bioRxiv : the preprint server for biology · 2026
CellPheno: A High-throughput Computational Platform for Quantifying Cellular Resolution Whole Brain Microscopy Images.
СтатьяПрепринтНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wei Ziquan, Curtin Ian, Kyere Felix A, Borland David, Yi Hong, Kim Minjeong, Dere Mustafa, McCormick Carolyn M, Krupa Oleh, Shih Yen-Yu Ian, Zylka Mark J, Stein Jason L, Wu Guorong
Аннотация
Advances in tissue clearing and light-sheet microscopy enable cellular resolution whole-brain 3D imaging. However, whole-brain quantification tools do not yet meet demands for efficiency or assess morphometry. Here we present CellPheno, a 3D nuclei instance segmentation framework for high-throughput cellular phenotyping. CellPheno quantifies an entire P4 mouse brain within 15 hours. We showcase whole-brain morphometry, enhanced stitching, and co-localization across multiple cell types in 53 brains.