Microbial genomics · 2019
LiSEQ - whole-genome sequencing of a cross-sectional survey of Listeria monocytogenes in ready-to-eat foods and human clinical cases in Europe.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Painset Anaïs, Björkman Jonas T, Kiil Kristoffer, Guillier Laurent, Mariet Jean-François, Félix Benjamin, Amar Corinne, Rotariu Ovidiu, Roussel Sophie, Perez-Reche Francisco, Brisse Sylvain, Moura Alexandra, Lecuit Marc, Forbes Ken, Strachan Norval, Grant Kathie, Møller-Nielsen Eva, Dallman Timothy J
Аннотация
We present the LiSEQ (Listeria SEQuencing) project, funded by the European Food Safety Agency (EFSA) to compare Listeria monocytogenes isolates collected in the European Union from ready-to-eat foods, compartments along the food chain (e.g. food-producing animals, food-processing environments) and humans. In this article, we report the molecular characterization of a selection of this data set employing whole-genome sequencing analysis. We present an overview of the strain diversity observed in different sampled sources, and characterize the isolates based on their virulence and resistance profile. We integrate into our analysis the global L. monocytogenes genome collection described by Moura and colleagues in 2016 to assess the representativeness of the LiSEQ collection in the context of known L. monocytogenes strain diversity.