STAR protocols · 2026
Protocol for spatial profiling of immune cells in the mouse cornea and conjunctiva using NanoString GeoMx DSP and nCounterPro platforms.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kim Lois, Ramasamy Karthikeyan, Sharma Ajay
Аннотация
Quantification of immune cells and their activation status in a spatially specific manner in a healthy or diseased tissue is a valuable tool in immunology. Here, we present a protocol for the spatial profiling of immune cells in the mouse cornea and conjunctiva. We describe steps for immunostaining with photocleavable oligonucleotide-conjugated antibodies, selecting regions of interest (ROIs), and collecting UV-cleaved oligonucleotides using GeoMx DSP. We then detail procedures for hybridizing collected oligonucleotides, cartridge blotting using nCounter Pro Prep, data acquisition, and data analysis.