DOI 10.64898/2026.01.09.26343788
Многоуровневый анализ генетических драйверов, связывающих аортальный стеноз и левую венерическую диастическую дисфункцию при сердечной недостаточности
Аннотация
Происходящий аортальный стеноз (AS) и левый желудочно-кишечный дисфункция (LVDD) часто сосуществуют в сердечной недостаточности (HF), однако механизмы, связывающие их, остаются неясными. В то время как СОС увеличивает после загрузки и поощряет миокардное ужесточение, появляющиеся данные, основанные на АИ, позволяют предположить, что ОДВД может предвосхищать разработку СОС или прогресс одновременно, указывая общие механобиологические и подстрекательские факторы вверх по течению. В этом исследовании анализируются генетические составители, соединяющие СОС и ЛДВД, с целью выявления ранних молекулярных маркеров и конвергентных путей в ВЧ. Метод мы проанализировали полную последовательность генома (РГС) и данные RNA-seq пациентов с ВЧ, полученные с использованием проб периферальных моноядерной крови (PBMC). Общий биоинформатический анализ был разделен на два модуля: 1) генный вариант и анализ аннотации и 2) генное выражение и анализ обогащения. Мы использовали опубликованный нами экспертный обзор и открытые трубопроводы WGS и RNA-seq для обработки данных о последовательности следующего поколения (NGS). Кроме того, мы провели биоинформатику и статистический анализ для выявления генетических вариаций, выражений, регулирования, обогащения и аннотаций к заболеваниям. Результаты мы определили генетические маркеры, которые являются уникальными, связанными с СОС, ЛДВД, и делились между ними. Кроме того, мы представляем информацию о генах с существенным выражением и функциональных вариациях и обсуждаем их связь с другими сердечно-сосудистыми заболеваниями (например, с сердечно-сосудистой и сердечно-сосудистой стойкостью, аортальной диссекцией, левой апробетной экспансией, левой венерической гипертрофией, порожними дефектами, бескомпромиссными заболеваниями короны, аритмией, кровотечением сердца, а также с гипертрофической, дилетантической и ишемической кардиопатией), а также с несердечными заболеваниями (некадрическими заболеваниями (например, диабетом типа 1, диабетом, диабетом, диабетом нефропатией, скелетными аномалиями, ремуалиями, ремуматоидным артритом, атипичной феморальной фрактурой, хронической киднейной болезнью, обезжирением, гептографическим стоматосисом, шизофренией, варикозой, высокоатной пульфонной Эдемой, периодонтией и реатрическим расстройством), включая многочисленные виды раковыых раковыых заболеваний (э, гамы, гамы, гамы, глады, глады, глады, глады, глады, глады, глады, геропсы, гамы, гексы, геросексуалы, гамы, геросексуалисты, геросексуалисты, гамы, гексы, гамы, геросексуалисты, гамы, гексы, гамы, гексы, гамы, гамы, гамы, гамы, гамы, гамы, гамы, геросексуалисты, геросексуалы, гамы, геросексуалисты, геросексуалисты, геросексуалисты, геросексуалы, геросексуалы, гамы, геросексуалы, гамы, гамы, гамы, геросексуалисты, высокоары, гамы, гамы, высокоары, высокоары, высокоары, высокоа, Дисплазия, лимфатическая магия ). Мы проверили наши результаты с помощью научной литературы, баз данных об аннотациях генов и электронных медицинских записей. Выводы AS и LVDD разделяют как клинические, так и геномные ассоциации с перекрывающимися генетическими движущими силами, которые обогащаются путями, связанными с воспалением, реконструкцией внеклеточной матрицы и реакцией на сосудистый стресс. Эта работа способствует укреплению потенциала многоомикологического профилирования на основе крови для выявления ранних, системных молекулярных сигналов сердечно-сосудистой дисфункции и закладывает основу для будущих исследований по конкретным тканям для определения точного диагноза, стратификации риска и целевых терапевтических методов в ВЧ.
Название и аннотация на языке оригинала
Multi-Omics Analysis of Genetic Drivers Linking Aortic Stenosis and Left Ventricular Diastolic Dysfunction in Heart Failure
Background Aortic stenosis (AS) and left ventricular diastolic dysfunction (LVDD) often coexist in heart failure (HF), but the mechanisms linking them remain unclear. While AS increases afterload and promotes myocardial stiffening, emerging AI-based evidence suggests LVDD can precede the development of AS or progress simultaneously, indicating shared upstream mechanobiological and inflammatory drivers. This study explores the genetic contributors connecting AS and LVDD to identify early molecular markers and convergent pathways in HF. Method We analyzed Whole Genome Sequence (WGS) and RNA-seq data of the HF patients, generated using their Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMCs) samples. Overall bioinformatics analysis was divided into two modules, 1) gene variant and annotation analysis, and 2) gene expression and enrichment analysis. We utilized our peer review published and open source WGS and RNA-seq pipelines to process Next-Generation Sequence (NGS) data. Furthermore, we performed bioinformatics and statistical analysis to identify genetic variations, expressions, regulation, enrichments, and disease annotations. Results We identified genetic markers uniquely associated with AS, LVDD, and shared between them. Furthermore, we report genes with significant expression, and functional variations, and discuss their relationship with other cardiovascular diseases (e.g., Vascular and Cardiac Stiffness, Aortic Dissection, Left Atrial Enlargement, Left Ventricular Hypertrophy, Outflow Tract Obstructive Defects, Non-Compaction Coronary Artery Disease, Arrhythmia, Congestive Heart Failure, and Hypertrophic, Dilated, and Ischemic Cardiomyopathy ) and non-cardiovascular diseases (non-CVDs) (e.g., Type 1 Diabetes, Diabetic Nephropathy, Skeletal Anomalies, Rheumatoid Arthritis, Atypical Femoral Fractures, Chronic Kidney Disease, Dehydrated Hereditary Stomatocytosis, Schizophrenia, Varicose Veins, High-Altitude Pulmonary Edema, Periodontitis, and Respiratory Disorder ) including multiple cancer types (e.g., Breast, Lung, Colorectal, Pancreatic, Hypopharyngeal, Acute Lymphoblastic, and Oral Squamous Cell Carcinomas ) and rare genetic disorders (e.g., Hypophosphatasia, Multiple Sclerosis, Campomelic Dysplasia, Lymphatic Malformation ). We validated our results through state of science literature, gene-disease annotation databases, and electronic health records. Conclusions AS and LVDD share both clinical and genomic associations, with overlapping genetic drivers that are enriched in pathways related to inflammation, extracellular matrix remodeling, and vascular stress responses. This work supports the potential of blood-based multi-omics profiling to uncover early, systemic molecular signals of cardiac dysfunction and lays the groundwork for future tissue-specific studies to guide precision diagnosis, risk stratification, and targeted therapeutics in HF.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.