Whole-genome sequencing and comparative genomic analysis of Irpex lacteus isolated from the female reproductive tract.
Аннотация
Irpex lacteus is a fungus typically found on angiosperm branches and trunks. Here, we report the isolation of a novel strain of I. lacteus from the cervix uteri of a female patient diagnosed with endometriosis and COVID-19 at Beijing Obstetrics and Gynecology Hospital, Capital Medical University. Using whole-genome sequencing, we generated a high-quality draft genome for this human-derived strain. Comparative genomic analysis revealed significant variations amongst I. lacteus strains colonizing distinct environments. Functional annotations indicated that environmental adaptation has influenced specific functional traits in the strains. Moreover, potential virulence factors were identified, implying a risk of opportunistic infections associated with I. lacteus. This study elucidates the adaptive characteristics of I. lacteus across ecological niches and provides genomic insights into its opportunistic colonization.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.