Science (New York, N.Y.) · 2002
Comparative genome sequencing for discovery of novel polymorphisms in Bacillus anthracis.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Read Timothy D, Salzberg Steven L, Pop Mihai, Shumway Martin, Umayam Lowell, Jiang Lingxia, Holtzapple Erik, Busch Joseph D, Smith Kimothy L, Schupp James M, Solomon Daniel, Keim Paul, Fraser Claire M
Аннотация
Comparison of the whole-genome sequence of Bacillus anthracis isolated from a victim of a recent bioterrorist anthrax attack with a reference reveals 60 new markers that include single nucleotide polymorphisms (SNPs), inserted or deleted sequences, and tandem repeats. Genome comparison detected four high-quality SNPs between the two sequenced B. anthracis chromosomes and seven differences among different preparations of the reference genome. These markers have been tested on a collection of anthrax isolates and were found to divide these samples into distinct families. These results demonstrate that genome-based analysis of microbial pathogens will provide a powerful new tool for investigation of infectious disease outbreaks.
Предметные рубрики MeSH
AnimalsAnthraxBacillus anthracisBacterial Typing TechniquesBase SequenceBioterrorismChromosome InversionComputational BiologyDisease OutbreaksGenetic MarkersGenetic VariationGenome, BacterialGenomicsHumansMinisatellite RepeatsMolecular Sequence DataMutationPhenotypePhylogenyPlasmidsPolymorphism, Single NucleotideRecombination, GeneticRepetitive Sequences, Nucleic AcidSequence Analysis, DNASequence DeletionSpecies SpecificityTransposasesVirulence