Database : the journal of biological databases and curation · 2021
Standardization of assay representation in the Ontology for Biomedical Investigations.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vita Randi, Zheng Jie, Jackson Rebecca, Dooley Damion, Overton James A, Miller Mark A, Berrios Daniel C, Scheuermann Richard H, He Yongqun, McGinty Hande Küçük, Brochhausen Mathias, Lin Aisyah Yu, Jain Sagar B, Chibucos Marcus C, Judkins John, Giglio Michelle G, Feng Irene Y, Burns Gully, Brush Matthew H, Peters Bjoern, Stoeckert Christian J
Аннотация
The Ontology for Biomedical Investigations (OBI) underwent a focused review of assay term annotations, logic and hierarchy with a goal to improve and standardize these terms. As a result, inconsistencies in W3C Web Ontology Language (OWL) expressions were identified and corrected, and additionally, standardized design patterns and a formalized template to maintain them were developed. We describe here this informative and productive process to describe the specific benefits and obstacles for OBI and the universal lessons for similar projects.