MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1093/bioinformatics/btag383

Медицинская библиотека · Bioinformatics (Oxford, England) · 2026

SEMPLR: an R package for transcription factor binding prediction.

Kenney Grace E, Sherpa Rintsen N, Burgess Jeremy D, Boyle Alan P, Phanstiel Douglas H

СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПеревод в очереди

Аннотация

SUMMARY: SEMPLR is an R package that predicts transcription factor binding and variant effects using SNP Effect Matrices (SEMs), providing efficient, genome-wide scoring, enrichment testing, and visualization tools for comprehensive analysis of regulatory sequences.

AVAILABILITY: Available on GitHub at https://github.com/grkenney/SEMPLR and on Bioconductor at https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/SEMPLR.html.

Для цитирования: Kenney Grace E, Sherpa Rintsen N, Burgess Jeremy D, Boyle Alan P, Phanstiel Douglas H. SEMPLR: an R package for transcription factor binding prediction.. Bioinformatics (Oxford, England). 2026. DOI: 10.1093/bioinformatics/btag383.

Предметные рубрики MeSH

Transcription FactorsSoftwarePolymorphism, Single NucleotideProtein BindingBinding SitesComputational Biology
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.