m+Medelevator.RU
← Поиск публикаций
Molecular genetics and genomics : MGG · 2024

Выявление общих патогенных сигнатур множественных склерозов и хронических обструктивных легочных заболеваний: комплексный транскриптомный анализ образцов крови.

СтатьяНазвание и аннотация: Машинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Mokaram Doust Delkhah Arman

Аннотация

Пациенты с множественным склерозом (МС) сталкиваются с повышенным риском возникновения хронической обструктивной легочной болезни (КОП). Несмотря на эту широко сообщенную связь, еще предстоит определить патогенные источники и процессы, которые могут способствовать развитию КПИ у пациентов с НР. Недавние исследования показали, что периферийные лейкоциты крови являются потенциальной связующим звеном между КСД и аутоиммунными расстройствами. Поэтому цель этого исследования состояла в том, чтобы открыть общие молекулярные сигнатуры между MS и КОПД с использованием транскриптомов крови. С этой целью из базы данных Gene Exposition Omnibus (GEO) были извлечены наборы генных экспрессий, полученные из MS и COPD образцов крови. Путем интеграции наборов данных, относящихся к каждому расстройству, для каждой болезни были определены дифференциально выраженные гены (DEG). Затем была построена белково-протеиновая сеть взаимодействия (ППИ) для совместного использования DEG между MS и КОПД. Впоследствии сеть была проанализирована с целью выявления узловых генов и ключевых регулирующих миРНС. Комплексные данные по НР охватывали 51 пробу (28 от пациентов, страдающих НР, и 23 от органов контроля), а комплексные данные по КПОД включали 450 проб (275 от пациентов КПОД и 175 от органов контроля). Было обнаружено в общей сложности 246 генов, которые демонстрируют идентичные направления выражения как в MS, так и в COPD. Применяя высокий порог доверия (0,7), была построена сеть ИЦП с 74 узлами. TP53, H4C6, SPRPE и RPS11 были определены в качестве узловых генов в зависимости от степени. Кроме того, в качестве ключевых регулирующих органов были определены 8 минорн, каждый из которых взаимодействует с 6 МРН. Среди этих миРНК miR-218-5p и miR-142-5p ранее сообщалось о том, что они способствуют патогенезу этих заболеваний, и здесь они были определены в качестве ключевых регуляторов совместной сети ИЦП, что указывает на потенциальную эпигенетическую связь между НР и КОПД. В заключение следует отметить, что результаты показали потенциальную роль периферийных лейкоцитов крови в качестве моста между РС и КОПД. Эти выводы расширяют наше понимание патогенных факторов, связывающих НР и КСД. В то время как в ходе этого исследования были выявлены многочисленные ключевые игроки, такие, как TP53, miR-218-5p и miR-142-5p, оценка их терапевтической эффективности требует дальнейших экспериментальных исследований.
Оригинал публикации

Identification of shared pathogenic signatures of multiple sclerosis and chronic obstructive pulmonary disease: an integrated transcriptomic analysis of blood specimens.

Patients with multiple sclerosis (MS) face a heightened risk of developing chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Despite this widely reported association, the pathogenic contributors and processes that may favor the development of COPD in MS patients have yet to be identified. Recent studies have suggested peripheral blood leukocytes as a potential link between COPD and autoimmune disorders. Therefore, this study aimed to unveil shared molecular signatures between MS and COPD using blood transcriptomes. To this end, gene expression datasets obtained from MS and COPD blood specimens were retrieved from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. By integrating datasets belonging to each disorder, differentially expressed genes (DEGs) were determined for each disease. Then, the protein-protein interaction (PPI) network was constructed for shared DEGs between MS and COPD. Subsequently, the network was analyzed to identify hub genes and key regulatory miRNAs. The integrated data for MS encompassed 51 samples (28 from MS patients and 23 from controls), and the integrated data for COPD included 450 samples (275 from COPD patients and 175 from controls). A total of 246 genes were found to exhibit identical directions of expression in both MS and COPD. By applying a high confidence threshold (0.7), a PPI network with 74 nodes was constructed. TP53, H4C6, SNRPE, and RPS11 were identified as hub genes according to the degree measure. In addition, 8 miRNAs were identified as key regulators, each interacting with 6 mRNAs. Among these miRNAs, miR-218-5p and miR-142-5p have been previously reported to contribute to the pathogenesis of these diseases, and here they were identified as key regulators of the shared PPI network, suggesting a potential epigenetic link between MS and COPD. In conclusion, the results highlighted the potential role of peripheral blood leucocytes as a bridge between MS and COPD. These findings broaden our understanding of pathogenic contributors linking MS and COPD. While this transcriptomics study identified multiple key players, such as TP53, miR-218-5p, and miR-142-5p, the assessment of their therapeutic efficacy demands further experimental studies.

Предметные рубрики MeSH

ИП Урсолов Владлен Сергеевич

ИНН 500118482352 · ОГРНИП 314500117700049

Реквизиты и контакты