Nature communications · 2022
Single-cell transcriptomics links malignant T cells to the tumor immune landscape in cutaneous T cell lymphoma.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liu Xiangjun, Jin Shanzhao, Hu Simeng, Li Ruoyan, Pan Haihao, Liu Yi, Lai Pan, Xu Deshu, Sun Jingru, Liu Ziyang, Gao Yumei, Zhao Yifan, Liu Fengjie, Xiao Yu, Li Yingyi, Wen Yujie, Chen Zhuojing, Xu Bufang, Lin Yuchieh, Ran Menglong, Li Qianxi, Yang Shuxia, Li Hang, Tu Ping, Haniffa Muzlifah, Teichmann Sarah A, Bai Fan, Wang Yang
Аннотация
Cutaneous T cell lymphoma (CTCL) represents a heterogeneous group of non-Hodgkin lymphoma distinguished by the presence of clonal malignant T cells. The heterogeneity of malignant T cells and the complex tumor microenvironment remain poorly characterized. With single-cell RNA analysis and bulk whole-exome sequencing on 19 skin lesions from 15 CTCL patients, we decipher the intra-tumor and inter-lesion diversity of CTCL patients and propose a multi-step tumor evolution model. We further establish a subtyping scheme based on the molecular features of malignant T cells and their pro-tumorigenic microenvironments: the TCyEM group, demonstrating a cytotoxic effector memory T cell phenotype, shows more M2 macrophages infiltration, while the TCM group, featured by a central memory T cell phenotype and adverse patient outcome, is infiltrated by highly exhausted CD8+ reactive T cells, B cells and Tregs with suppressive activities. Our results establish a solid basis for understanding the nature of CTCL and pave the way for future precision medicine for CTCL patients.