m+Medelevator.RU
← Поиск публикаций
Biochemical and biophysical research communications · 2025

Изучение общих диагностических генов и молекулярных механизмов в множестве склероза и псориаза с помощью биоинформатического анализа и машинного обучения.

СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Машинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Kong Yuting, Li Xinmin, Yang Fangjie, Wang Jing, Guo Pengxue, Ren Chunlin, Duan Zhenfei, Bi Mengyao, Wang Ye, Liu Feizhou, Zhang Yasu

Аннотация

Множественный склероз (MS) и псориаз являются и иммунизированными подстрекательскими заболеваниями. В предыдущих исследованиях сообщалось о соприкасаемости между НР и psoriasis, однако основополагающие механизмы остаются неясными. Цель этого исследования состоит в том, чтобы прояснить общие патогенез и основные гены, лежащие в основе MS и psoriais. МЕТОДЫ: Данные о микроаррасе для MS и psoriais были загружены из базы данных ГНЗ. Дифференциально выраженные гены (DEGs) анализировались с помощью пакета "limma". Анализы функционального обогащения были проведены для разъяснения биологических функций общих ОЭГ. Анализ ИЦП и машинное обучение использовались для отбора основных генов, а диагностическая эффективность оценивалась с использованием номограмм. Были проведены анализ одиночных клеток и строительство сети CeRNA. Инфильтрация иммунной клетки оценивалась путем обогащения одного образца генома. Прогнозирование наркотиков, молекулярная стыковка и моделирование молекулярной динамики (MD) выявили потенциальные терапевтические препараты. РЕЗУЛЬТАТЫ: 89 ОВП, идентифицированных в наборах данных MS и psorias, были обогащены рецепторами NOD, NF-ИВ и JAK-STAT. IL7R и IRF8 были определены в качестве основных генов с хорошей диагностической эффективностью (AUC >0.7). Анализ иммунной инфильтрации показал дисрегулирование активированных CD4 T клеток, активированных дендритных клеток и гамма-дельта Т клеток в обоих болезнях. Анализ одиночных клеток показал, что IL7R и IRF8 выражаются главным образом в иммунных клетках. Молекулярная стыковка и симуляция MD показали, что партенолид является потенциальным терапевтическим агентом. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: В настоящем исследовании подчеркивается критическая роль регулирования иммунной дистрибуции и хронического воспаления в MS и psorias comorbidity. IL7R и IRF8 были определены в качестве основных генов и новых целей вмешательства в отношении обоих заболеваний. Эти выводы позволяют получить новые сведения для будущих исследований.
Оригинал публикации

Exploring shared diagnostic genes and molecular mechanisms in multiple sclerosis and psoriasis through bioinformatics analysis and machine learning.

BACKGROUND: Multiple sclerosis (MS) and psoriasis are both immune-mediated inflammatory diseases. Previous studies have reported comorbidity between MS and psoriasis, but the underlying mechanisms remain unclear. This study aims to elucidate the shared pathogenesis and core genes underlying MS and psoriasis.

METHODS: Microarray data for MS and psoriasis were downloaded from the GEO database. Differentially expressed genes (DEGs) were analyzed using "limma" package. Functional enrichment analyses were conducted to elucidate biological functions of common DEGs. PPI analysis and machine learning were used to select core genes, and the diagnostic efficacy was evaluated using nomograms. Single-cell analysis and CeRNA network construction were performed. Immune cell infiltration was assessed by single-sample gene set enrichment. Drug prediction, molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations identified potential therapeutic drugs.

RESULTS: 89 DEGs identified in MS and psoriasis datasets were enriched in the NOD-like receptor, NF-κB, and JAK-STAT signaling pathways. IL7R and IRF8 were determined as core genes with good diagnostic performance (AUC >0.7). Immune infiltration analysis showed dysregulation of activated CD4 T cells, activated dendritic cells, and gamma delta T cells in both diseases. Single-cell analysis suggested that IL7R and IRF8 were mainly expressed in immune cells. Molecular docking and MD simulations revealed that parthenolide is a potential therapeutic agent.

CONCLUSION: This study highlights the critical role of immune dysregulation and chronic inflammation in MS and psoriasis comorbidity. IL7R and IRF8 were identified as core genes and novel intervention targets for both diseases. These findings provide new insights for future research.

Предметные рубрики MeSH

ИП Урсолов Владлен Сергеевич

ИНН 500118482352 · ОГРНИП 314500117700049

Реквизиты и контакты