Сетевая идентификация регулятивных центров и терапевтических целей в множестве склерозов: комплексный подход к транскрипционному и молекулярному стыку.

Множественный склероз (MS) — хроническое нейродегенеративное заболевание, характеризующееся воспалением, обезвоживанием и нейронной потерей. Несмотря на проведенные исследования, механизмы остаются неясными, что требует дальнейшего изучения путей и целей лечения. МЕТОДЫ: Для анализа данных о экспрессии генов из базы данных ГЭП (GSE135511) использовался подход, основанный на биоинформатических данных. Дифференциально выраженные гены (DEG) были выявлены и подвергнуты анализу на предмет обогащения GO и KEGG. Сеть взаимодействия белков и протеинов (ППИ) была построена с помощью ТРИНГ и цитоскапе с ключевыми генами узлов, обнаруженными через CytoHubba. Функциональное кластерирование осуществлялось с использованием системы ClassONE, а движущая сила − с помощью комплекта MEME. Наконец, была проведена проверка базы данных " DrugBank " , с тем чтобы выявить потенциальные возможности взаимодействия между наркологическими целями и белками. Молекулярная стыковка была проведена для оценки связующих связей между выявленными лекарствами и целевыми белками. РЕЗУЛЬТАТЫ: Анализ функционального обогащения показал участие окислительной фосфорилации, иммунного регулирования и нейродегенеративных путей в MS. Анализ сети ИЦП идентифицировал SLC32A1, PVALB, GAD1, GAD2, SNAP25, NRXN1, CDC42 и CD44 в качестве ключевых узловых белков. Функциональное кластерирование выявило различные биологические модули, связанные с метаболизмом митохондриала, иммунитетом и реконструкцией цитоскелета. Анализ мотивов стимулятора позволил выявить сайты, связанные с коэффициентом транскрипции и регулирующие нейронное выживание и апоптоз. Анализ взаимодействия между наркотиками и целевыми соединениями, за которым последовала молекулярная стыковка с использованием PyRx, продемонстрировал сильные связующие связи между белками и эндогенными или утвержденными соединениями: NRXN1 с цитратом кальция (-7,4 ккал/моль), GAD1 с пиридоксальным фосфатом (-6,7 ккал/моль), CD44 с гиалюроновой кислотой (-6,8 ккал/моль). Эти выводы дают новое представление о ключевых молекулярных механизмах и поддающихся контролю целевых показателях в рамках патологии MS. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: В настоящем исследовании представлен молекулярный ландшафт MS, интегрирующий генное выражение, обогащение траектории, анализ регулирования и стратегии фармакотерапии. Полученные результаты свидетельствуют о новых исследованиях патогенеза MS и определяют перспективные терапевтические цели для клинической проверки.