Экзомная последовательность не прикрывает генетические движущие силы множественного склероза в семье мультиплексов.
Аннотация
Фон: Множественный склероз (MS) представляет собой хроническое, аутоиммунное, многофакторное и сложное расстройство центральной нервной системы (CNS), затрагивающее более 2 миллионов человек во всем мире. Исследования ассоциации геномов (GWAS) объясняют лишь небольшую долю его высокой наследственности, подчеркивая необходимость альтернативных подходов к выявлению редких генетических вариантов, способствующих его этиологии. Для решения этой проблемы в многострадальной семье мы провели целую последовательность (WES).
Методы
WES была осуществлена в семье с несколькими поколениями, состоящей из двух затронутых сестер, двух здоровых братьев и одного ребенка.
Результаты
Анализ биоинформатики выявил 47 совместных редких вариантов. Три варианта ошибки в генах, связанных с воспалением, автонепроницаемостью и демиелинизацией, были названы наиболее перспективными кандидатами: c.443 C>T, p.Pro148Leu в гене RTN4, c.1678 T>G, p.Phe560Val в гене JAK2, и c.3449 A>G, p.Tyr1150Cys в гене DUOX2. Модель протеина и силико-инструменты позволяют предположить, что три выбранных варианта могут оказать значительное влияние на функцию белка.
Выводы
Мы определили новые потенциальные гены для MS в семействе мультиплексов, что является доказательством олигогенной модели подверженности заболеваниям. Для подтверждения этих предварительных результатов требуется дальнейшее копирование и проведение функциональных исследований.
Название и аннотация на языке оригинала
Exome Sequencing Uncovers Genetic Drivers of Multiple Sclerosis in a Multiplex Family.
Background
Multiple Sclerosis (MS) is a chronic, autoimmune, multifactorial, and complex disorder of the central nervous system (CNS), affecting more than 2 million individuals globally. Genome-wide association studies (GWAS) have explained only a small fraction of its high heritability, highlighting the need for alternative approaches to identify rare genetic variants that contribute to its etiology. To address this, we performed whole-exome sequencing (WES) in a multi-affected family.
Methods
WES was performed in a MS multigenerational family comprising two affected sisters, their two healthy brothers, and one affected son.
Results
Bioinformatics analysis identified 47 co-segregating rare variants. Three missense variants in genes involved in inflammation, autoimmunity, and demyelinization were identified as the most promising candidates: c.443 C>T, p.Pro148Leu in the RTN4 gene, c.1678 T>G, p.Phe560Val in the JAK2 gene, and c.3449 A>G, p.Tyr1150Cys in the DUOX2 gene. Protein modeling and in silico tools suggest that the three selected variants may have a significant impact on protein function.
Conclusions
We identified novel candidate genes for MS in a multiplex family, providing evidence for an oligogenic model of disease susceptibility. Further replication and functional studies are required to validate these preliminary results.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.