Интегрирование геномических, eQTL и менделианских рентгеномизационных анализов для выявления микроглиальных целевых показателей в мультиклерозе.

Множественный склероз (MS) — аутоиммунное заболевание, характеризующееся нейроинфламмацией и нейродегенерацией. В этом исследовании анализируются генетические и иммунологические факторы в MS с уделением особого внимания микроглиальному регулированию. Мы проанализировали дифференциально выраженные гены с использованием последовательности RNA на основе повреждений MS (GSE108000) и таблеток (GSE227781), подтвержденных с помощью анализа acis-eQTL и интегрированной менделийской случайности (MR), SMR, совместной локализации, метилации и взаимодействия белков и протеиновых протеинов (PPI) для оценки причинно-следственного воздействия на риск MS. Мы идентифицировали пять генов-ARHGAP25, HLA-DRB1, MERTK, MS4A6A и SYK, связанных с MS-чувствительностью. MR показал, что повышенные уровни ARHGAP25 (OR = 1,45), HLA-DRB1 (OR = 2,24), MERTK (OR = 1,10), MS4A6A (OR = 1,15) и SYK (OR = 1,13) повысили риск MS. ВСР подтвердил наличие причинно-следственной связи между HLA-DRB1 и MS, в то время как анализ совместной локализации показал общие с MS варианты для HLA-DRB1 (100%) и SYK (97,93%). Анализ бромистого метила выявил 10 участков в рамках HLA-DRB1, а анализ PIP и DrugBank выявил взаимодействие между этими генами и множеством белков или химических веществ. Это исследование показывает ценность интеграции геномных и eQTL данных через MR для выявления новых целей лечения MS, в частности микроглиальных генов, открывающих потенциальные новые возможности для лечения.