m+Medelevator.RU
← Поиск публикаций
Scientific reports · 2025

Воздействие мутации CYP27B1 p.R389H на стабильность и функцию белка: последствия для множественных патогенеза склероза.

СтатьяНазвание и аннотация: Машинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Kiani Rizwan Ahmed, Wattoo Feroza Hamid, Khan Muhammad Umer, Munir Maha, Sattar Sadaf, Kazmi Mehreen, Jamila, Rehman Raima, Shan Muhammad Adnan, Ali Qurban, Iqbal Adnan, Ali Daoud

Аннотация

Ген CYP27B1 имеет решающее значение для метаболизма витамина D, который регулирует иммунные функции. Такие мутации, как p.R389H, могут нарушить стабильность и функцию белка, что может оказывать влияние на такие заболевания, как множественный склероз (MS). В настоящем исследовании рассматриваются структурные и функциональные последствия мутации CYP27B1 p.R389H (rs118204009) и ее потенциальная роль в патогенезе MS. Последовательность CYP27B1 (UniProt ID: O15528) была найдена, и ее 3D-структура была предсказана с помощью AlphaFold. P.R389H мутация была введена через PyMOL для оценки структурных и функциональных изменений. Структурная проверка проводилась с использованием анализа участка ERRAT2, ERIFY3D и RamLeign. Стабильность была проанализирована с помощью I-Mutant, Mcsm, DDGun, DynaMut и Mupro, а функциональное воздействие было предсказано с помощью PoliPhen-2, докторской диссертации, SNPs&GO и SIFT. Оценка эволюционного сохранения проводилась совместно с компанией " Консерф " . AlphaFold предсказала высокую уверенность в 3D-структуре CYP27B1 (pLDDT > 90), высветив p.R389H мутации, где аргинин заменяется гистидином. Структурная проверка показала минимальное нарушение, в то время как филогенетический анализ выявил местоположение мутации в охраняемом регионе, подчеркнув ее потенциальное функциональное значение. Анализ устойчивости прогнозирует дестабилизирующее воздействие (диапазон значений ΔG от - 0,3 до - 2,038 ккал/моль), а инструменты функционального воздействия классифицируют мутации как "вероятно вредные" и связанные с болезнями. Молекульное моделирование динамики еще больше подкрепило эти результаты, разоблачив изменившееся структурное поведение мутантов-белков с ограниченной гибкостью и стабильностью. Согласно расчетам, мутация p.R389H (rs118204009) может негативно сказаться на роли CYP27B1 в метаболизме витамина D, что может способствовать патогенезу MS.
Оригинал публикации

Impact of the CYP27B1 p.R389H mutation on protein stability and function: implications for multiple sclerosis pathogenesis.

The CYP27B1 gene is crucial for vitamin D metabolism, which regulates immune functions. Mutations such as p.R389H may disrupt protein stability and function, potentially influencing diseases like multiple sclerosis (MS). This study examines the structural and functional consequences of the CYP27B1 p.R389H (rs118204009) mutation and its potential role in MS pathogenesis. The CYP27B1 sequence (UniProt ID: O15528) was retrieved, and its 3D structure was predicted using AlphaFold. The p.R389H mutation was introduced via PyMOL to assess structural and functional changes. Structural validation was conducted using ERRAT2, VERIFY3D, and Ramachandran plot analysis. Stability was analyzed using I-Mutant, Mcsm, DDGun, DynaMut, and Mupro, while functional impact was predicted with PolyPhen-2, PhD-SNP, SNPs&GO, and SIFT. Evolutionary conservation was assessed with ConSurf. AlphaFold predicted a high-confidence 3D structure of CYP27B1 (pLDDT > 90), highlighting the p.R389H mutation, where arginine is substituted by histidine. Structural validation showed minimal disruption, while phylogenetic analysis identified the mutation's location in a conserved region, highlighting its potential functional significance. Stability analysis predicted a destabilizing effect (ΔΔG values ranging from - 0.3 to - 2.038 kcal/mol), and functional impact tools classified the mutation as "probably damaging" and disease-associated. Molecular dynamics simulations further supported these results by revealing altered structural behavior of the mutant protein, with reduced flexibility and stability. Computational findings suggested p.R389H (rs118204009) mutation could impair the role of CYP27B1 in vitamin D metabolism, potentially contributing to MS pathogenesis.

Предметные рубрики MeSH

ИП Урсолов Владлен Сергеевич

ИНН 500118482352 · ОГРНИП 314500117700049

Реквизиты и контакты