PICRUST2 Анализ Fecal Microbiome ассоциируется с Murine Model of Multical Sclerosis.

Множественный склероз (MS) — изнуряющее нервно-воспалительное заболевание центральной нервной системы (КНС). Считается, что в мире около 2-3 млн. человек имеют НР. Растет интерес к механистической связи между MS и кишечным микробиомом. Экспериментальный аутоиммунный энцефаломиелит (EAE) — мусриновая модель воспалительного демиэлирования CNS, которая обычно используется для исследования патологии MS в связи с микробиомом. Предыдущие исследования показали, что EAE влияет на кишечник микробиома, и совершенствование EAE может способствовать развитию микробиомного гомеостаза. Микробиом гомеостаз имеет решающее значение для здоровья хозяина, поскольку он способствует иммунальному регулированию и производит биодоступные метаболические продукты в пищеварительном тракте. Несколько факторов, включая диету, генетику и окружающую среду, оказывают влияние на гомеостаз микробиома, помимо состояния болезней. Наша лаборатория ранее показала, что мыши одной и той же генетической линии, полученные от различных производителей, демонстрируют различия в составе микробиома, несмотря на то, что они размещены в аналогичных условиях. Кроме того, эти мыши продемонстрировали вариации в прогрессии и серьезности EAE, что указывает на то, что различия в микробиоме могут способствовать расхождениям в EAE. Здесь мы используем PICRUST2 для оценки функциональных различий в микробиомах мышей EAE из различных источников в ключевые моменты времени во время курса EAE по болезням. Повторный анализ данных о микробиоме показывает явные различия в прогнозируемом генном выражении микробиомов, которые непропорционально связаны с метаболизмом аминокислот, углеводов, липидов и других метаболитов. Наши выводы подтверждают предыдущие наблюдения, касающиеся изменения микробиома в контексте ЕАЭ, и свидетельствуют о том, что оценка динамики микробиома выиграла бы от таксономической оценки и метаболической активности, что позволило бы разработать более эффективные и всеобъемлющие исследовательские стратегии.