Всеобъемлющая мета-анализа дифференциально выраженных протеинов в цереброспайнальной жидкости, ассоциируемой с множественным склерозом.

Для углубления нашего понимания множественного склероза (MS) решающее значение имеет точное определение профилей белкового выражения в качестве биомаркеров для MS в цереброспинальной жидкости (CSF). Однако протеомические исследования, посвященные изучению НР, дали противоречивые результаты из-за изменчивости размеров выборки, диагностических критериев и методов обработки данных. Мы стремились решить эти проблемы путем проведения углубленного метаанализа протеомических наборов данных, полученных в результате многочисленных независимых исследований. Мы провели тщательный поиск базы данных для сбора всех соответствующих исследований с использованием соответствующих ключевых слов. Мы проверили статьи с использованием определенных критериев включения и исключения, и, наконец, в них были включены шесть исследований. Мы собрали и объединили данные из пяти наборов данных CSF для обнаружения и двух дополнительных наборов данных для проверки 368 пациентов MS и контроля. После предварительной обработки данных мы рассчитали Z-показатели для всех наборов данных и интегрированного набора данных. Мы использовали модели логистической регрессии, используя наборы данных для обучения и проверки. Мы выявили 11 различных белков в наборе интегрированных данных, что выявило значительные изменения в ключевых путях, связанных с иммунной реакцией, нейроинфламмацией и синаптической функцией. В частности, у ИГКЦ был мощный диагностический потенциал, а АУРОК - 0,81. Эти выводы подчеркивают ценность повторного анализа общедоступных протеомических данных для разработки надежных биомаркеров для диагностики НР.