Microbial genomics · 2017
Whole-genome sequencing of bloodstream Staphylococcus aureus isolates does not distinguish bacteraemia from endocarditis.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lilje Berit, Rasmussen Rasmus Vedby, Dahl Anders, Stegger Marc, Skov Robert Leo, Fowler Vance G, Ng Kim Lee, Kiil Kristoffer, Larsen Anders Rhod, Petersen Andreas, Johansen Helle Krogh, Schønheyder Henrik Carl, Arpi Magnus, Rosenvinge Flemming S, Korup Eva, Høst Ulla, Hassager Christian, Gill Sabine Ute Alice, Hansen Thomas Fritz, Johannesen Thor Bech, Smit Jesper, Søgaard Peter, Skytt Andersen Paal, Eske-Bruun Niels
Аннотация
Most Staphylococcus aureus isolates can cause invasive disease given the right circumstances, but it is unknown if some isolates are more likely to cause severe infections than others. S. aureus bloodstream isolates from 120 patients with definite infective endocarditis and 121 with S. aureus bacteraemia without infective endocarditis underwent whole-genome sequencing. Genome-wide association analysis was performed using a variety of bioinformatics approaches including SNP analysis, accessory genome analysis and k-mer based analysis. Core and accessory genome analyses found no association with either of the two clinical groups. In this study, the genome sequences of S. aureus bloodstream isolates did not discriminate between bacteraemia and infective endocarditis. Based on our study and the current literature, it is not convincing that a specific S. aureus genotype is clearly associated to infective endocarditis in patients with S. aureus bacteraemia.