The journal of physical chemistry. B · 2026
RheoKit: A Workflow for Green-Kubo Viscosity Analysis in Tinker and Tinker-HP.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Relix Daniel, Torabifard Hedieh
Аннотация
We present RheoKit, a workflow that automates viscosity calculations via the Green-Kubo formalism in Tinker 25 and Tinker-HP. Additionally, we introduce new user-facing enhancements to Tinker 25 and Tinker-HP that expose stress tensor data upon request. We validate the implementation and workflow by calculating the viscosity of water, ethanol, isopropanol, and toluene using the AMOEBA polarizable force field. Our results confirm the accuracy of our implementation and suggest that AMOEBA may benefit from parameter tuning for improved experimental agreement.