MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1093/database/baag056

Медицинская библиотека · Database : the journal of biological databases and curation · 2026

I-NOWJ: adaptive context selection and knowledge-guided learning for substance use named entity recognition.

Tran Quoc-Viet-Anh, Duong Gia-Bao, Tran Huu-Huy-Hoang, Vuong Thi-Hai-Yen, Le Hoang-Quynh

СтатьяПеревод в очереди

Аннотация

Substance use information in clinical narratives is clinically important but is typically documented in unstructured and informal text, making automatic extraction challenging, particularly in low-resource and non-English settings. The BioCreative IX ToxHabits shared task addresses this problem in Spanish clinical text by identifying substance use triggers and their arguments. In this paper, we introduce I-NOWJ, which addresses these challenges through two complementary strategies: a low-resource strategy based on domain knowledge expansion, controlled data augmentation with quality-aware self-training, and an adaptive context selection mechanism that determines the appropriate contextual scope for each instance. Experimental results on the ToxHabits benchmark show that I-NOWJ achieves an F1 score of 94.93% on trigger detection and 91.30% on argument extraction. These results demonstrate the effectiveness of knowledge-guided modelling and adaptive context selection for robust clinical named entity recognition in low-resource settings. Our implementation and resources are publicly available at: https://github.com/candleMind/toxhabit.

Для цитирования: Tran Quoc-Viet-Anh, Duong Gia-Bao, Tran Huu-Huy-Hoang, Vuong Thi-Hai-Yen, Le Hoang-Quynh. I-NOWJ: adaptive context selection and knowledge-guided learning for substance use named entity recognition.. Database : the journal of biological databases and curation. 2026. DOI: 10.1093/database/baag056.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.