Journal of proteome research · 2025
Plasma Fractionation and Mixture Improves Coverage in Proteomic Analysis.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liu Ting, Chen Han, Song Yuning, Ye Xiang, Wang Dan, Zhang Qiuhong, Liu Huiru, Sha Jiaojiao, Du Liangjia, Qi Shanyu, Geng Zijin, Hu Qianqian, Wang Yanyang, Cai Minqi, Chen Dezhu, Song Hongyan, Pan Jie, Chen Yiqiang, Ling Tianze, Chang Cheng, Bai Bing
Аннотация
Expanding plasma proteome coverage increases the success in proteomic discovery of blood biomarkers. Here we report that the sequential precipitation of plasma by increasing concentrations of acetonitrile (AcN) can fractionate proteins. Combining some of these fractions with other fractions from polyethylene glycol (PEG) precipitation and albumin depletion to have the mixed sample that included these partitioned fractions: 10% whole plasma, 20% 20%-AcN-pellet, 10% 40%-AcN-pellet, 20% 50%-AcN-supernatant, 20% 10%-PEG-precipitation-albumin-depletion, and 20% 20%-PEG-precipitation-albumin-depletion, has yielded identification of 5441 proteins, remarkably larger than the 2040 proteins detected in the whole plasma directly. This study provides nearly the largest plasma proteomics data sets and recommends this fractionation and mixture strategy as an efficient approach for expanded plasma proteomics coverage.