MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1093/nar/gkz822

Медицинская библиотека · Nucleic acids research · 2020

OGRDB: a reference database of inferred immune receptor genes.

Lees William, Busse Christian E, Corcoran Martin, Ohlin Mats, Scheepers Cathrine, Matsen Frederick A, Yaari Gur, Watson Corey T, AIRR Community, Collins Andrew, Shepherd Adrian J

СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПеревод в очереди

Аннотация

High-throughput sequencing of the adaptive immune receptor repertoire (AIRR-seq) is providing unprecedented insights into the immune response to disease and into the development of immune disorders. The accurate interpretation of AIRR-seq data depends on the existence of comprehensive germline gene reference sets. Current sets are known to be incomplete and unrepresentative of the degree of polymorphism and diversity in human and animal populations. A key issue is the complexity of the genomic regions in which they lie, which, because of the presence of multiple repeats, insertions and deletions, have not proved tractable with short-read whole genome sequencing. Recently, tools and methods for inferring such gene sequences from AIRR-seq datasets have become available, and a community approach has been developed for the expert review and publication of such inferences. Here, we present OGRDB, the Open Germline Receptor Database (https://ogrdb.airr-community.org), a public resource for the submission, review and publication of previously unknown receptor germline sequences together with supporting evidence.

Для цитирования: Lees William, Busse Christian E, Corcoran Martin, Ohlin Mats, Scheepers Cathrine, Matsen Frederick A, Yaari Gur, Watson Corey T, AIRR Community, Collins Andrew, Shepherd Adrian J. OGRDB: a reference database of inferred immune receptor genes.. Nucleic acids research. 2020. DOI: 10.1093/nar/gkz822.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.