Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) · 2026
A Droplet Digital PCR Approach for the Quantitative Detection of Fusobacterium nucleatum in Formaldehyde-Fixed, Paraffin-Embedded Tumor Tissues.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kahsai Orsalem, Phipps Amanda I, Newcomb Polly A, Hullar Meredith A J
Аннотация
Fusobacterium nucleatum, a prevalent component of the intratumoral microbiome, has been associated with reduced survival in colorectal cancer. To enable sensitive and specific detection of F. nucleatum in tumor specimens, we developed a droplet digital PCR (ddPCR) assay targeting the transcription termination/anti-termination gene nusG, normalized to host tissue content using the solute carrier organic anion transporter family member 2A1 gene, SLCO2A1. Here, we present a ddPCR protocol optimized for quantifying F. nucleatum DNA in human genomic DNA extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumor tissues. This methodology has been refined for high-throughput application, supporting large-scale analyses of F. nucleatum prevalence in tumor samples.