MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1038/s41587-026-03082-8

Медицинская библиотека · Nature biotechnology · 2026

Structure-centric searching enables global mapping of the public metabolome.

El Abiead Yasin, Seo Jeong In, Charron-Lamoureux Vincent, Strobel Michael, Gonçalves Nunes Wilhan Donizete, Zhao Haoqi Nina, Kvitne Kine Eide, Zuffa Simone, Mannochio-Russo Helena, Gouda Harsha, Bez Cristina, Patan Abubaker, Xing Shipei, Zemlin Jasmine, Mohany Ipsita, Agongo Julius, Caraballo Rodriguez Andres Mauricio, Burnett Lindsey A, Deleray Victoria, Pakkir Shah Abzer K, Kalinski Jarmo-Charles, Petras Daniel, Alygizakis Nikiforos, Carver Jeremy, Yurekten Ozgur, Payne Thomas, Fahy Eoin, Subramaniam Shankar, Vizcaíno Juan Antonio, Wang Mingxun, Dorrestein Pieter C

СтатьяПеревод в очереди

Аннотация

Searching and learning from aggregated public metabolomics data spanning thousands of studies remained largely inaccessible. Here we present StructureMASST, a web-based application enabling scalable, structure-centric searches across public metabolomics repositories using molecule names or chemical representations. It queries a precomputed knowledgebase of 2.19 billion spectral matches and 420 million metadata links, supports modification-tolerant and mass-shift searches, and maps chemical structures across taxonomy, biological context and environmental conditions to accelerate discovery.

Для цитирования: El Abiead Yasin, Seo Jeong In, Charron-Lamoureux Vincent, Strobel Michael, Gonçalves Nunes Wilhan Donizete, Zhao Haoqi Nina, Kvitne Kine Eide, Zuffa Simone, Mannochio-Russo Helena, Gouda Harsha, Bez Cristina, Patan Abubaker, Xing Shipei, Zemlin Jasmine, Mohany Ipsita, Agongo Julius, Caraballo Rodriguez Andres Mauricio, Burnett Lindsey A, Deleray Victoria, Pakkir Shah Abzer K, Kalinski Jarmo-Charles, Petras Daniel, Alygizakis Nikiforos, Carver Jeremy, Yurekten Ozgur, Payne Thomas, Fahy Eoin, Subramaniam Shankar, Vizcaíno Juan Antonio, Wang Mingxun, Dorrestein Pieter C. Structure-centric searching enables global mapping of the public metabolome.. Nature biotechnology. 2026. DOI: 10.1038/s41587-026-03082-8.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.