PLoS biology · 2026
Life Identification Numbers: A strain nomenclature approach to aid epidemiological surveillance of bacterial pathogens.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Palma Federica, Hennart Melanie, Jolley Keith A, Crestani Chiara, Wyres Kelly L, Bridel Sebastien, Yeats Corin A, Brancotte Bryan, Raffestin Brice, David Sophia, Lam Margaret M C, Izdebski Radosław, Passet Virginie, Rodrigues Carla, Rethoret-Pasty Martin, Combary Audrey, Cottis Solene, Maiden Martin C J, Aanensen David M, Holt Kathryn E, Criscuolo Alexis, Brisse Sylvain
Аннотация
Unified strain taxonomies are needed for the epidemiological surveillance of bacterial pathogens and international communication in microbiological research. Core genome multilocus sequence typing (cgMLST) holds great promise for standardized high-resolution strain genotyping. However, this approach faces challenges including classification instability and disconnection of new nomenclature from widely adopted classical MLST identifiers. This Essay discusses the cgMLST-based Life Identification Number (LIN) method, recently proposed as a stable multilevel strain taxonomy system applicable to most bacterial pathogens, covering how LIN codes are implemented and used in practice for precise strain definitions and epidemiological tracking.