STAR protocols · 2026
Protocol for the identification of recent HIV infection in newly diagnosed individuals.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wulan Wahyu Nawang, Lokida Dewi, Yunihastuti Evy, Kosasih Herman, Arlinda Dona, Lau Chuen-Yen, Neal Aaron, Sudarmono Pratiwi P, Maldarelli Frank
Аннотация
Recent HIV infection often goes undetected, which complicates incidence estimation, a key metric for understanding HIV spread. We present a protocol to estimate infection recency in newly diagnosed individuals using a multi-assay algorithm (MAA) integrating immunological and virological biomarkers of HIV disease progression. We describe steps for CD4+ T cell enumeration, viral load quantification, antibody avidity testing, RNA extraction, nested PCR of HIV-1 pol, Sanger sequencing, and sequence ambiguity quantification. This approach enables recency determination when seroconversion dates are unavailable. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Wulan et al.1.