MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1186/s13059-020-1926-6

Медицинская библиотека · Genome biology · 2020

Eleven grand challenges in single-cell data science.

Lähnemann David, Köster Johannes, Szczurek Ewa, McCarthy Davis J, Hicks Stephanie C, Robinson Mark D, Vallejos Catalina A, Campbell Kieran R, Beerenwinkel Niko, Mahfouz Ahmed, Pinello Luca, Skums Pavel, Stamatakis Alexandros, Attolini Camille Stephan-Otto, Aparicio Samuel, Baaijens Jasmijn, Balvert Marleen, Barbanson Buys de, Cappuccio Antonio, Corleone Giacomo, Dutilh Bas E, Florescu Maria, Guryev Victor, Holmer Rens, Jahn Katharina, Lobo Thamar Jessurun, Keizer Emma M, Khatri Indu, Kielbasa Szymon M, Korbel Jan O, Kozlov Alexey M, Kuo Tzu-Hao, Lelieveldt Boudewijn P F, Mandoiu Ion I, Marioni John C, Marschall Tobias, Mölder Felix, Niknejad Amir, Rączkowska Alicja, Reinders Marcel, Ridder Jeroen de, Saliba Antoine-Emmanuel, Somarakis Antonios, Stegle Oliver, Theis Fabian J, Yang Huan, Zelikovsky Alex, McHardy Alice C, Raphael Benjamin J, Shah Sohrab P, Schönhuth Alexander

СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорПеревод в очереди

Аннотация

The recent boom in microfluidics and combinatorial indexing strategies, combined with low sequencing costs, has empowered single-cell sequencing technology. Thousands-or even millions-of cells analyzed in a single experiment amount to a data revolution in single-cell biology and pose unique data science problems. Here, we outline eleven challenges that will be central to bringing this emerging field of single-cell data science forward. For each challenge, we highlight motivating research questions, review prior work, and formulate open problems. This compendium is for established researchers, newcomers, and students alike, highlighting interesting and rewarding problems for the coming years.

Для цитирования: Lähnemann David, Köster Johannes, Szczurek Ewa, McCarthy Davis J, Hicks Stephanie C, Robinson Mark D, Vallejos Catalina A, Campbell Kieran R, Beerenwinkel Niko, Mahfouz Ahmed, Pinello Luca, Skums Pavel, Stamatakis Alexandros, Attolini Camille Stephan-Otto, Aparicio Samuel, Baaijens Jasmijn, Balvert Marleen, Barbanson Buys de, Cappuccio Antonio, Corleone Giacomo, Dutilh Bas E, Florescu Maria, Guryev Victor, Holmer Rens, Jahn Katharina, Lobo Thamar Jessurun, Keizer Emma M, Khatri Indu, Kielbasa Szymon M, Korbel Jan O, Kozlov Alexey M, Kuo Tzu-Hao, Lelieveldt Boudewijn P F, Mandoiu Ion I, Marioni John C, Marschall Tobias, Mölder Felix, Niknejad Amir, Rączkowska Alicja, Reinders Marcel, Ridder Jeroen de, Saliba Antoine-Emmanuel, Somarakis Antonios, Stegle Oliver, Theis Fabian J, Yang Huan, Zelikovsky Alex, McHardy Alice C, Raphael Benjamin J, Shah Sohrab P, Schönhuth Alexander. Eleven grand challenges in single-cell data science.. Genome biology. 2020. DOI: 10.1186/s13059-020-1926-6.

Предметные рубрики MeSH

AnimalsData ScienceGenomicsHumansRNA-SeqSingle-Cell Analysis
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.