MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1093/g3journal/jkaf103

Медицинская библиотека · G3 (Bethesda, Md.) · 2025

Genome report: whole-genome assembly of the relapsing fever tick Ornithodoros turicata Dugès (Acari: Argasidae).

Tietjen Mackenzie, Stahlke Amanda R, Luecke David, Saelao Perot, Sim Sheina B, Geib Scott M, Scheffler Brian E, Childers Anna K, Kneubehl Alexander R, Teel Pete D, Lopez Job E

СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПеревод в очереди

Аннотация

The soft tick family Argasidae contains vectors of medical and veterinary importance, but few molecular resources are available compared to hard ticks (Ixodidae). One example is Ornithodoros turicata, a recognized vector of Borrelia turicatae, causal agent of human relapsing fever, and a putative vector of African swine fever virus. To address the current lack of molecular resources for the Argasidae, we generated a chromosome-level genome assembly for O. turicata using PacBio sequencing in conjunction with an Illumina Hi-C library. The resulting reference genome has a total of 1.1 Gb in length and was assembled into 10 chromosomes and 368 unplaced scaffolds, an N50 of 2.7 Mb, and a QV score of 43.58. The orthology analysis indicated high-quality with a 97.8% BUSCO completeness score and 36,149 annotated genes. 33% of the genome was identified as repeats and masked. The generation of the first soft tick reference genome establishes a basis for future studies to utilize genomic tools to support vector-borne disease management.

Для цитирования: Tietjen Mackenzie, Stahlke Amanda R, Luecke David, Saelao Perot, Sim Sheina B, Geib Scott M, Scheffler Brian E, Childers Anna K, Kneubehl Alexander R, Teel Pete D, Lopez Job E. Genome report: whole-genome assembly of the relapsing fever tick Ornithodoros turicata Dugès (Acari: Argasidae).. G3 (Bethesda, Md.). 2025. DOI: 10.1093/g3journal/jkaf103.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.