Сравнительный анализ молекулярных маркеров для обнаружения и идентификации борелия спирочат в иксодесе рицинус.
Аннотация
Borrelia burdorferi sensu lato, переносимый клещами Ixodes, является одним из самых значительных человеческих патогенов, вызывающих болезнь Лайма. Поскольку стандартизованного метода ПЦР для обнаружения и идентификации спирохетной ДНК не существует, мы провели сравнительный анализ с использованием набора дополнительных капсулов для трех регионов геномной ДНК этих бактерий (генесы fla и rrs и некодирующая область rrs-rrlA). ДНК, взятая из 579 клещей рикодов, была подвергнута воздействию ПЦР в гнездах. ДНК обследованных спирочат была обнаружена в 43 (7,4%) лизатах, когда ген фла использовался в качестве молекулярного маркера, в 7 (1,2%) лизатах при использовании капсюлей, дополняющих ген rrs, и в 12 (2,1%) лизатах с использованием подстилок, дополняющих последовательность некодирования rrs-rrlA. Анализ RFLP, основанный на гене фла, помог выявить виды из комплекса B. burgdorferi sensu lato (B. burdorferi sensu stricto, Borrelia afzelii, Borrelia garinii, Borrelia valaliiana), выявить соинфекции, а также Борелия miyamotoi. Таким образом, ген фла является наиболее чувствительным и конкретным молекулярным маркером для обнаружения и идентификации спирохет Боррелии в I. ricinus.
Название и аннотация на языке оригинала
A comparative analysis of molecular markers for the detection and identification of Borrelia spirochaetes in Ixodes ricinus.
Borrelia burgdorferi sensu lato, carried by Ixodes ticks, is one of the most significant human pathogens, causing Lyme disease. As there is no standardized PCR method for detection and identification of spirochaete DNA, we carried out a comparative analysis using a set of complementary primers for three regions in the genomic DNA of these bacteria (genes fla and rrs and the non-coding rrs-rrlA region). DNA extracted from 579 Ixodes ricinus ticks was subjected to nested PCR. DNA of the examined spirochaetes was detected in 43 (7.4 %) lysates when the fla gene was used as a molecular marker, in 7 (1.2 %) lysates when using primers complementary to the rrs gene, and in 12 (2.1 %) lysates using primers complementary to the non-coding rrs-rrlA sequence. RFLP analysis based on the fla gene helped identify species from the B. burgdorferi sensu lato complex (B. burgdorferi sensu stricto, Borrelia afzelii, Borrelia garinii, Borrelia valaisiana), detect co-infections, and also identify Borrelia miyamotoi. Therefore, the fla gene is the most sensitive and specific molecular marker for the detection and identification of Borrelia spirochaetes in I. ricinus.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.