MedElevator
Войти в исследования DOI 10.3389/fmicb.2023.1182604
Распространение резистентных к лекарственным препаратам генов в альвеолярной воде от пациентов с пситтакозом и анализ отслеживаемости причинных организмов.
Аннотация
КОЛИЧЕСТВО: Chlamidia psittaci — небольшой бактерий, часто встречающийся у птиц, включая птицу, и одомашненных млекопитающих, который вызывает пситтакоз (или попугая лихорадка) у людей. Различные штаммы C. psittaci в разной степени реагируют на антибиотики, что говорит о возможном риске антибиотической устойчивости. В целом различные генотипы C. psittaci имеют относительно стабильные приемные устройства и различную патогенность.
МЕТОДЫ
Макрогеномическая последовательность была произведена с использованием нуклеиновых кислот, взятых из образцов жидкости из альвеолярного туалета пациентов, и проанализирована на предмет генетической изменчивости и генов антибиотического сопротивления. Были использованы последовательности амплификации нуклеиновой кислоты, характерные для области кодирования C. psittaci ompA, и было построено филогенетическое дерево с последовательности C. psittaci genotypic из других источников, включая китайские опубликованные источники. Пситтачи, найденные в каждом пациенте, были генотипированы путем сопоставления генопоследовательности OmpA. Кроме того, для более наглядной иллюстрации взаимосвязи между генотипом и носителями C. psittaci из магазинов по продаже птиц было собрано 60 образцов фекального мяса птиц для проверки и печатания C. psittaci.
Результаты
Макрогеномическая последовательность выявила наличие генов сопротивления в разном изобилии в образцах всех трех пациентов, включая генные последовательности резистентности C. psittaci у двух пациентов, которые совпадали с ранее опубликованными на NCDI. Судя по генотипу Омпа, два пациента были заражены генотипом А C. psittaci и один пациент был заражен генотипом B. Все пять образцов, полученных из магазинов по продаже птиц, были генотипом А. Согласно сообщениям, оба генотипа являются инфекционными для людей. Приемные образцы и ранее сообщенные основные источники каждого генотипа свидетельствуют о том, что все, за исключением одного, генотипа С. psittaci A в этом исследовании были получены из попугая, в то время как генотип В, вероятно, был получен из кур.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
На эффективность клинической антибиотической терапии может влиять присутствие генов бактериальной устойчивости у пациентов, страдающих пситтакозом. Сосредоточение внимания на развитии генов бактериальной устойчивости и различия в терапевтической эффективности могут способствовать эффективному лечению клинических бактериальных инфекций. Генотипы патогенности (например, генотип А и генотип В) не ограничиваются одним животным носителем, что говорит о том, что мониторинг развития и изменений C. psittaci может способствовать предотвращению передачи инфекции на человека.
Название и аннотация на языке оригинала
Distribution of drug-resistant genes in alveolar lavage fluid from patients with psittacosis and traceability analysis of causative organisms.
BACKGROUND
Chlamydia psittaci is a small bacterium often found in birds, including poultry, and domesticated mammals, which causes psittacosis (or parrot fever) in humans. Different strains of C. psittaci respond variably to antibiotics, suggesting a possible risk of antibiotic resistance. In general, different genotypes of C. psittaci have relatively stable hosts and different pathogenicity.
METHODS
Macrogenomic sequencing was performed using nucleic acids extracted from psittacosis patients' alveolar lavage fluid samples and analyzed for genetic variability and antibiotic resistance genes. Nucleic acid amplification sequences specific to the core coding region of the C. psittaci ompA gene were used, and a phylogenetic tree was constructed with C. psittaci genotypic sequences from other sources, including Chinese published sources. The C. psittaci found in each patient were genotyped by comparing ompA gene sequences. In addition, to better illustrate the relationship between genotype and host of C. psittaci, 60 bird fecal samples were collected from bird-selling stores for screening and C. psittaci typing.
RESULTS
Macrogenomic sequence alignment revealed the presence of resistance genes in varying abundance in samples from all three patients, including C. psittaci resistance gene sequences from two patients that matched those previously published on NCBI. Based on ompA genotyping, two patients were infected with C. psittaci genotype A and one patient was infected with genotype B. All five C. psittaci-positive samples obtained from bird-selling stores were genotype A. Both genotypes are reported to be infectious to humans. The host origin of the samples and the previously reported main sources of each genotype suggested that all but one of the C. psittaci genotype A in this study were derived from parrots, while genotype B was probably derived from chickens.
CONCLUSION
The presence of bacterial resistance genes in psittacosis patients may affect the efficacy of clinical antibiotic therapy. Focusing on the developmental progression of bacterial resistance genes and differences in the therapeutic efficacy may facilitate effective treatment of clinical bacterial infections. Pathogenicity genotypes (e.g., genotype A and genotype B) are not limited to one animal host, suggesting that monitoring the development and changes of C. psittaci may help prevent transmission to humans.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.