DOI 10.1371/journal.pone.0261088
Вектор широкого спектра клонирования, который существует как в качестве интегрированного элемента, так и свободного плазмида в хламидии трахомати.
Аннотация
Плазмидная трансформация хламидии создала новые возможности для изучения взаимодействия хостинг-микроб во время хламидиальных инфекций; однако все еще существуют ограничения. Плазмидная трансформация требует репликона, полученного из местного плазмида хламидии, и эти преобразования зависят от конкретного вида. Мы изучили полезность широкого плазмида хост-диапазона PBBR1MCS-4 для преобразования хламидии с целью упрощения процесса преобразования. Плазмид был модифицирован для содержания хромосомной ДНК из C. trachomatis, чтобы облегчить гомологическую рекомбинацию. Вектор PBR1MCS-4 был клонирован последовательности флангирующих инкрементов вместе с GPF:CAT-кассета из PSW2-GFP хламидиального челночного вектора. Окончательная конструкция плазмида PBVR2 была успешно преобразована в штамм C. trachomatis L2-434. Микроскопия иммунофлюоресценции была проанализирована хламидиальными трансформантами, а позитивные клоны были последовательно очищены с помощью ограничения разбавления. Для определения того, поддерживается ли плазмид в хромосоме или как эпизон, использовались целая последовательность генома на основе PCR и PacBio. Последовательность действий клонированных трансформантов PacBio выявила аллонический обмен информацией между хромосомой и плазмидом PBVR2, который заменил хромосомную инкА плазмидом GFP:CAT кассетой. Данные также свидетельствуют о полной интеграции плазмида в бактериальную хромосому. В то время как некоторые плазмиды были полностью интегрированы, некоторые из них оставались эпизом и могли быть очищены и преобразованы в E. coli. Таким образом, плазмид может быть успешно преобразован в хламидию без хламидиального происхождения репликации и может существовать во многих штатах в преобразованном населении.
Название и аннотация на языке оригинала
A broad-spectrum cloning vector that exists as both an integrated element and a free plasmid in Chlamydia trachomatis.
Plasmid transformation of chlamydiae has created new opportunities to investigate host-microbe interactions during chlamydial infections; however, there are still limitations. Plasmid transformation requires a replicon derived from the native Chlamydia plasmid, and these transformations are species-specific. We explored the utility of a broad host-range plasmid, pBBR1MCS-4, to transform chlamydiae, with a goal of simplifying the transformation process. The plasmid was modified to contain chromosomal DNA from C. trachomatis to facilitate homologous recombination. Sequences flanking incA were cloned into the pBBR1MCS-4 vector along with the GFP:CAT cassette from the pSW2-GFP chlamydial shuttle vector. The final plasmid construct, pBVR2, was successfully transformed into C. trachomatis strain L2-434. Chlamydial transformants were analyzed by immunofluorescence microscopy and positive clones were sequentially purified using limiting dilution. PCR and PacBio-based whole genome sequencing were used to determine if the plasmid was maintained within the chromosome or as an episome. PacBio sequencing of the cloned transformants revealed allelic exchange events between the chromosome and plasmid pBVR2 that replaced chromosomal incA with the plasmid GFP:CAT cassette. The data also showed evidence of full integration of the plasmid into the bacterial chromosome. While some plasmids were fully integrated, some were maintained as episomes and could be purified and retransformed into E. coli. Thus, the plasmid can be successfully transformed into chlamydia without a chlamydial origin of replication and can exist in multiple states within a transformed population.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.