Идентификация потенциальных лекарственных средств, предназначенных для Л, L-диаминопимелата аминопереносазы хламидио-трахоматиса: комплексный фармакоинформатический подход.
Аннотация
Chlamidia trachomatis (C.t) — граммоотрицательная внутриклеточная бактерия, которая является одной из основных причин инфекционной слепоты и заболеваний, передаваемых половым путем. Резкий рост резистентности к многочисленным лекарственным средствам у хламидиальных видов создал проблему для принятия альтернативных стратегий целеопределения наркотиков. Недавно в C.t, L-диаминопимелат аминопереносазы (CtDAP-AT) оказался потенциальной целью наркотиков, поскольку она играет важнейшую роль в выживании клеток и неконкретности принимающей стороны. Таким образом, в рамках данного исследования было проведено многоуровневое виртуальное тестирование CtDAP-AT на основе точности для выявления потенциальных ингибиторов, в ходе которого интегральная жесткая опрокидка и фильтрация производились с помощью сцепки, скользящего стыкателя, связывания свободной энергии, ADMET (абсорбция, распределение, метаболизм и экскреция, токсичность), функциональной теории плотности (квантовая механика) и моделирования молекулярной динамики (молекулярная механика). В результате совокупного анализа был сделан вывод о том, что наиболее потенциальным свинецом является NSC_5485 (1,3-бис(7-хлор-4-кинолинил)амино-2-пропанол), поскольку он продемонстрировал более высокую последовательность с точки зрения связующих связей, взаимодействий, благоприятного АДМЕТ, химической реактивности и большей стабилизации во время сложного образования. Настоящий доклад представляет собой первый доклад о приоритезации небольших молекул, полученных от Национального института раковых заболеваний (НИК) и Мэйбриджских наборов данных (341 519 соединений) в интересах CtDAP-AT. Таким образом, предлагаемый комплекс будет способствовать эффективной борьбе с широким спектром инфекций C.t, поскольку он превышает все уровни приоритизации.
Название и аннотация на языке оригинала
Identification of potential drugs targeting L,L-diaminopimelate aminotransferase of Chlamydia trachomatis: An integrative pharmacoinformatics approach.
Chlamydia trachomatis (C.t) is a gram-negative obligate intracellular bacteria, which is a major causative of infectious blindness and sexually transmitted diseases. A surge in multidrug resistance among chlamydial species has posed a challenge to adopt alternative drug targeting strategies. Recently, in C.t, L,L-diaminopimelate aminotransferase (CtDAP-AT) is proven to be a potential drug target due its essential role in cell survival and host nonspecificity. Hence, in this study, a multilevel precision-based virtual screening of CtDAP-AT was performed to identify potential inhibitors, wherein, an integrative stringent scoring and filtration were performed by coupling, glide docking score, binding free energy, ADMET (absorption, distribution, metabolism, and excretion, toxicity) prediction, density functional theory (quantum mechanics), and molecular dynamics simulation (molecular mechanics). On cumulative analysis, NSC_5485 (1,3-bis((7-chloro-4-quinolinyl)amino)-2-propanol) was found to be the most potential lead, as it showed higher order significance in terms of binding affinity, bonded interactions, favorable ADMET, chemical reactivity, and greater stabilization during complex formation. This is the first report on prioritization of small molecules from National Cancer Institute (NCI) and Maybridge data sets (341 519 compounds) towards targeting CtDAP-AT. Thus, the proposed compound shall aid in effective combating of a broad spectrum of C.t infections as it surpassed all the levels of prioritization.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.