Боковой Gene Translation между Girant Viruses of Family Mimiviridae и Chlamidiae.

Обязанность к внутриклеточному хламидии разошлась в патогенном и экологическом хламидии 0,7-1,4 миллиарда лет назад. В то время как патогенные хламидии адаптировались к широкому кругу позвоночных, экологические хламидии обитают в одноклеточном амебе, свободном акантамоэбе. Однако вопрос о том, каким образом и почему произошло это расхождение, остается неясным. В то же время были обнаружены гигантские вирусы, состоящие из вирусов протозоа и вирусов, связанных с вирусом протозоа, при этом предполагается, что первая группа в большей степени повлияла на окружающую среду хламидиаи во время их эволюции, в то время как в ней проживала амоэба. На этом фоне мы попытались визуализировать гены гигантских вирусов в хламидиальных геномах путем биоинформатического анализа, главным образом с помощью сравнительного генома и филогенного анализа, стремясь найти гены, присутствующие в хламидиае, которые специально делятся с протозоа связанными с ним гигантскими вирусами. В результате, в отличие от гигантских вирусов, связанных с протозоа, гены гигантских вирусов, связанных с протозоа, были в значительной степени распространены в обоих геномах хламидии в зависимости от типа гигантского вируса. В частности, в хламидиальных генах, связанных с протозоа, наблюдалось значительное распространение генов Mimiviridae. В то же время распространенность связанных с протозоа гигантских вирусных генов в патогенных геномах хламидии постоянно выше, чем в экологических хламидиях; фактическое число последовательности, сходное с гигантским вирусом, также значительно преобладало по сравнению с последовательности в экологических хламидиальных геномах. Среди них наиболее распространенный гигантский вирус был в случае хламидии с цилинзом Мегавируса; было установлено, что с вирусом делятся в общей сложности 1338 генов хламидии (444 гена, характерные для окружающей среды хламидии, 892 гена, разделяемые обеими хламидией, только два гена в патогенной хламидии). Филогенный анализ с наиболее распространенными наборами (Megavirus chiliensis and Protochlamidia EI2 или Chlamidia trachomatis L2 434Bu) показал наличие ортопедов между ними с несколькими группами. Кроме того, единичный регрессионный анализ Пирсона показал, что почти распространенность генов гигантских вирусов в хламидиальных геномах была негативной и непосредственно коррелировала с числом хламидиальных открытых считывающих систем (ОРФ). Таким образом, эти результаты указывают на след боковой передачи генов между связанными с протозоа гигантскими вирусами семейства Мимивиридае и хламидией. Это первая демонстрация предполагаемой связи между хламидией и гигантскими вирусами, дающая нам нам нам намек на понимание хламидиальной эволюции.