MedElevator
Войти в исследования Генотифицирование горнчего Коксиеллы из домашних румын в северной Испании.
Аннотация
Информация о генотипическом разнообразии коксиеллы горнетии, изолированной от зараженных домашних румынов в Испании, является ограниченной. Цель этого исследования состояла в том, чтобы выявить генотипы C. signetii, заражающие скот в Северной Испании, и сравнить их с другими европейскими генотипами. Коммерческая ПЦР в режиме реального времени, направленная на элемент ввода IS1111a, была использована для обнаружения присутствия ДНК C. signetii в домашних румынках из Испании. Генотипы были определены с помощью табличного анализа 6-лицилиндрового многоразового смешения чисел (MLVA) и многопространственного секвенирования (MST).
Результаты
В исследование были включены в общей сложности 45 образцов из 4 козьих стада (плашины, N = 4), 12 молочных стадов скота (вагинальный слизь, индивидуальное молоко, наливное молоко, аэрозоли, N = 20) и 5 овец (плажа, вагинальные мазки, феки, пробы воздуха, пыль, N = 21). Образцы из коз и овец были получены из стада, где были сделаны аборты, которые, как предполагается, были вызваны С. Генотипы, выявленные у романов из Испании, были сопоставлены с генотипами, обнаруженными в других странах. Три генотипа MLVA были обнаружены на 4 фермах коз, 7 генотипов MLVA были обнаружены на 12 стадах скота и 4 генотипа MLVA были обнаружены на 5 стадах овец. Группирование генотипов MLVA с использованием метода наименьшего тарирования деревьев показало высокую степень генетического сходства между большинством генотипов MLVA. В общей сложности было получено 11 различных генотипов MLVA, соответствующих 4 различным генотипам MST: MST генотип 13, выявленный у козлов, овец и скота из Испании; MST генотип 18, указанный только у коз; и MST генотипы 8 и 20, выявленные, соответственно, у мелких червей и скота. Все эти генотипы были ранее выявлены в клинических образцах животных и человека из нескольких европейских стран, но некоторые генотипы MLVA впервые описаны здесь.
ВЫВОДЫ
Генотипинг выявил значительное генетическое разнообразие среди домашних румын из Северной Испании.
Название и аннотация на языке оригинала
Genotyping of Coxiella burnetii from domestic ruminants in northern Spain.
BACKGROUND
Information on the genotypic diversity of Coxiella burnetii isolates from infected domestic ruminants in Spain is limited. The aim of this study was to identify the C. burnetii genotypes infecting livestock in Northern Spain and compare them to other European genotypes. A commercial real-time PCR targeting the IS1111a insertion element was used to detect the presence of C. burnetii DNA in domestic ruminants from Spain. Genotypes were determined by a 6-loci Multiple Locus Variable number tandem repeat analysis (MLVA) panel and Multispacer Sequence Typing (MST).
RESULTS
A total of 45 samples from 4 goat herds (placentas, N = 4), 12 dairy cattle herds (vaginal mucus, individual milk, bulk tank milk, aerosols, N = 20) and 5 sheep flocks (placenta, vaginal swabs, faeces, air samples, dust, N = 21) were included in the study. Samples from goats and sheep were obtained from herds which had suffered abortions suspected to be caused by C. burnetii, whereas cattle samples were obtained from animals with reproductive problems compatible with C. burnetii infection, or consisted of bulk tank milk (BTM) samples from a Q fever surveillance programme. C. burnetii genotypes identified in ruminants from Spain were compared to those detected in other countries. Three MLVA genotypes were found in 4 goat farms, 7 MLVA genotypes were identified in 12 cattle herds and 4 MLVA genotypes were identified in 5 sheep flocks. Clustering of the MLVA genotypes using the minimum spanning tree method showed a high degree of genetic similarity between most MLVA genotypes. Overall 11 different MLVA genotypes were obtained corresponding to 4 different MST genotypes: MST genotype 13, identified in goat, sheep and cattle from Spain; MST genotype 18, only identified in goats; and, MST genotypes 8 and 20, identified in small ruminants and cattle, respectively. All these genotypes had been previously identified in animal and human clinical samples from several European countries, but some of the MLVA genotypes are described here for the first time.
CONCLUSIONS
Genotyping revealed a substantial genetic diversity among domestic ruminants from Northern Spain.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.