DOI 10.1016/j.virusres.2021.198501
Монсавирус в обезьяньем ректальном мазке и глоточном мазке в Китае: предложение для Posaliviridae в качестве новой семьи в Пикорнавиралесе.
Аннотация
Позаподобные вирусы были обнаружены в фекалийных образцах нескольких видов и считаются неклассифицированными членами Picornavirales. Здесь мы идентифицировали геномные фрагменты новых поза-подобных вирусов (монсавирусов) в обезьяньих образцах на протяжении следующего поколения и получили 11 полных геномов. Этот музавирус имел 88,5-89,2% нуклеотидное сходство с штаммом Tottori-HG1 (GenBank Communication LC123275). В общей сложности было выявлено 713 участков полиморфизма нуклеотида, что свидетельствует об их устойчивой эволюции во время циркуляции. Были определены геномная организация и филогенетические отношения музавируса. Последующий филогенетический анализ сохраненного репликационного блока Hel-Pro-RdRp и ключевого анализа на основе РНК полимеразы на основе домена вирусов, сходных с озой, показал значительное разделение по сравнению с другими известными семьями. Кроме того, позоноподобные вирусные геномы обладали классическим блоком воспроизведения пикорнавируса в 5-й части генома и пикорнаподобных доменах капсида в области структурного кодирования 3-й части генома. Исходя из этих результатов, мы предложили новую семью Позаливиридае, в Пикорнавиралесе. Было выявлено четыре рода, которые показали 68,6-75,5% дистанции аминокислот, но аналогичную геномную организацию, включая сохранившийся блок воспроизведения Hel-Pro-RdRp, тот же порядок района геномного кодирования и пикорнаподобные области капсида. Гибкая стратегия организации геномов и крупные эволюционные масштабы Posaliviridae являются очевидными. В этом исследовании содержится новая информация о мосвирусах и важные таксономические данные о семье Позаливиридае.
Название и аннотация на языке оригинала
Monsavirus in monkey rectal swab and throat swab specimens in China: Proposal for Posaliviridae as a new family in Picornavirales.
Posa-like viruses have been detected in the fecal samples of several host species and are considered unclassified members of Picornavirales. Here, we identified genomic fragments of novel posa-like viruses (monsaviruses) in monkey specimens through next generation sequencing and obtained 11 full-length genomes. This monsavirus shared 88.5-89.2% nucleotide similarity with the Tottori-HG1 strain (GenBank accession LC123275). In total, 713 nucleotide polymorphism sites were identified, indicating their persistent evolution during circulation. The genomic organization and phylogenetic relationship of monsavirus were determined. Subsequent phylogenetic analysis of the conserved replication block of Hel-Pro-RdRp and core RNA-dependent RNA polymerase domain-based analysis of posa-like viruses showed significant separation compared with other known families. Further, posa-like virus genomes possessed the classical replication block of picornavirus in the 5' part of genome and picorna-like capsid domains at the structural coding region of 3' part of genome. Based on these results, we proposed the new family Posaliviridae, within Picornavirales. Four genera, which showed 68.6-75.5% amino acid distances but similar genomic organization including the conserved replication block of Hel-Pro-RdRp, the same order of the genomic coding region, and picorna-like capsid domains, were identified. The flexible genomic organization strategy and a large evolutionary scale of Posaliviridae was explicit. This study provides novel information on monsaviruses and important taxonomic data for the family Posaliviridae.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.