Nature communications · 2023
Genomic attributes of Vibrio cholerae O1 responsible for 2022 massive cholera outbreak in Bangladesh.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monir Md Mamun, Islam Mohammad Tarequl, Mazumder Razib, Mondal Dinesh, Nahar Kazi Sumaita, Sultana Marzia, Morita Masatomo, Ohnishi Makoto, Huq Anwar, Watanabe Haruo, Qadri Firdausi, Rahman Mustafizur, Thomson Nicholas, Seed Kimberley, Colwell Rita R, Ahmed Tahmeed, Alam Munirul
Аннотация
In 2022, one of its worst cholera outbreaks began in Bangladesh and the icddr,b Dhaka hospital treated more than 1300 patients and ca. 42,000 diarrheal cases from March-1 to April-10, 20221. Here, we present genomic attributes of V. cholerae O1 responsible for the 2022 Dhaka outbreak and 960 7th pandemic El Tor (7PET) strains from 88 countries. Results show strains isolated during the Dhaka outbreak cluster with 7PET wave-3 global clade strains, but comprise subclade BD-1.2, for which the most recent common ancestor appears to be that responsible for recent endemic cholera in India. BD-1.2 strains are present in Bangladesh since 2016, but not establishing dominance over BD-2 lineage strains2 until 2018 and predominantly associated with endemic cholera. In conclusion, the recent shift in lineage and genetic attributes, including serotype switching of BD-1.2 from Ogawa to Inaba, may explain the increasing number of cholera cases in Bangladesh.