Исследование по всему гену связывает ген MTMR7 с вариантом Creutzfeldt-Jakob риска.

Цель нашего исследования состояла в том, чтобы выявить геномные вариации, связанные с возможностью заболевания Crewzfeldt-Jakob (vCJD). Был проведен анализ связи генома с большинством имеющихся в мире образцов vCJD. На стадии обнаружения была включена серия из 93 пациентов vCJD UK и 1504 британских контролеров. Наши наилучшие результаты были воспроизведены в независимом населении, состоящем из 22 дел Соединенного Королевства и 20 французских дел vCJD. Постспециальный анализ для оценки наших основных результатов включал в себя 5711 французских механизмов контроля, 445 нидерландских механизмов контроля и 446 эпизодических случаев заболевания Crewzfeldt-Jakob. Мы обнаружили 2 важных варианта генома, помещающих PRNP: rs6107516 (p = 2,6 × 10(18)) и rs2065706 (p = 8,8 × 10(-14)). Две другие нуклеотидные полиморфизмы (SNP) (rs4921542 и rs7565981) были успешно воспроизведены в независимых образцах и достигли общего значения в геноме после объединения популяций, которые были обнаружены и воспроизведены. Rs4921542 (p = 1,6 × 10(-8)) — интронический вариант белка миотубиллярина 7 гена (MTMR7), непосредственно выраженный в центральной нервной системе (CNS) и дефосфорилатах фосфатидилинозитола 3-фосфата и иноситола 1,3-бисфосфата. Rs7565981 (p = 4,2 × 10(8))) находится в межгенной области перед нейронной ССА (на-ARNT-sim), содержащимся в домене протеиновый ген 2 (NPAS2), регулируемый ген, принадлежащий семейству факторов транскрипции, которые были связаны с памятью, сезонным аффективным расстройством и молекулярными часами в предплечье млекопитающих. Для регулирования гена фосфолипазы C-дельта-3 (PLCD3) в трансе было обнаружено косвенное значение rs7565981 (rs17024792; r(2) = 1.0). Этот фермент катализирует гидролиз фосфатидилинозитола 4,5-бисфосфата. Наше исследование выявило 2 новых важных маркера по всему геному для vCJD вне PRNP и дает доказательства, подтверждающие роль фосфатидилинозитола в уязвимости vCJD.