Генетический отслеживание Рабида Койота (Canis latrans), обнаруженного за пределами района Рабис-Энзоотии в Западной Вирджинии, США.

Перенос живой природы и трансплантация между видами могут препятствовать борьбе с новыми зоонотические заболеваниями и их ликвидации. Отслеживание географического происхождения как принимающих, так и вирусов (т.е. транслокация по отношению к локальной инфекции) может помочь определить наиболее эффективные меры реагирования в тех случаях, когда выявляются особо опасные случаи возникновения патогенов в дикой природе. В мае 2022 года в графстве Льюис, Западная Вирджиния, США, был собран койот (Canis latrans), инфицированный вирусом енот (просион лотор) бешенства (RRV). Мы применили геномику и филогенетический анализ принимающего населения для определения наиболее вероятного географического происхождения бешеного койота. Геномический анализ койотов включал в себя животных из многих восточных штатов, граничащих с Западной Виргинией, где вероятно происхождение бешеного койота было округом коллекции. Филогенетические анализы RRV включали случаи, обнаруженные в Западной Вирджинии и соседних штатах, при этом наиболее схожие последовательности RRV собирались в графстве в 80 км к северо-востоку в зоне пероральной вакцинации от бешенства. Совокупные результаты свидетельствуют о том, что койот был инфицирован в зоне управления RRV и перенес RRV в графство Льюис, что соответствует модели местной экологии движения койотов. Дистанционная межвидовая трансмиссия и последующее перемещение носителей сопряжены с низким риском для дальнейшей передачи в популяциях енотов. Эта информация способствовала принятию решений в связи с чрезвычайными ситуациями, что позволило сэкономить время и ресурсы.