PloS one · 2021
Cracking it - successful mRNA extraction for digital gene expression analysis from decalcified, formalin-fixed and paraffin-embedded bone tissue.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saraji Alireza, Offermann Anne, Stegmann-Frehse Janine, Hempel Katharina, Kang Duan, Krupar Rosemarie, Watermann Christian, Jonigk Danny, Kühnel Mark Philipp, Kirfel Jutta, Perner Sven, Sailer Verena
Аннотация
With the advance of precision medicine, the availability of tumor tissue for molecular analysis has become a limiting factor. This is particularly the case for bone metastases which are frequently occurring in cancer types such as prostate cancer. Due to the necessary decalcification process it was long thought that transcriptome analysis will not be feasible from decalcified formalin-fixed, paraffin-embedded (DFFPE) in a large manner. Here we demonstrate that mRNA extraction from DFFPE is feasible, quick, robust and reproducible and that decalcification does not hamper subsequent gene expression analysis. This might assist in implementing transcriptome analysis from DFFPE into every day practice.