DOI 10.3389/fcimb.2023.1013842
Вирус Рабиза в уникальной форме перепрограммирует транскриптом макрофагов, созданных на основе моноцитов человека.
Аннотация
Макропаж относится к числу первых иммунных клеток, которые сталкиваются с вирусом бешенства (RABV) в местах проникновения вируса. Активация макрофага имеет существенно важное значение для начала мощной иммунной реакции, однако мало что известно о воздействии РАБВ на активацию макрофага. В этом исследовании мы провели секвенирование с высокой производительностью на РНК, извлекаемой из макрофаги, которые подвергались воздействию RABV в течение 48 часов, и сравнили их транскрипционные профили с профилями не поляризированных макрофагов (M0) и макрофазов, поляризированных по отношению к каноническим M1, M2a и M2c фенотипов. Наш анализ показал, что макрофаги RABV имеют высокое выражение нескольких генов сигнатур M1, M2a и M2c. Помимо их частичного сходства с этими фенотипами, беспристрастный кластерный анализ показал, что RABV вызывает уникальную и отличную программу поляризации. Более тщательный анализ показал, что РАБВ вызвал множество путей, связанных с интерфероном и антивирусной реакцией, которые не были вызваны другими классическими стратегиями поляризации. Удивительно, но наши данные показывают, что RABV вызывает активированную, а не полностью подавленную фенотип макрофага, вызывая активацию и поляризацию, вызванные вирусом. Это включает в себя несколько генов с известными антивирусными (например. APOBEC3A, IFIT/OFA/TRIM гены), которые могут играть определенную роль в иммунитете против RABV.
Название и аннотация на языке оригинала
Rabies virus uniquely reprograms the transcriptome of human monocyte-derived macrophages.
Macrophages are amongst the first immune cells that encounter rabies virus (RABV) at virus entry sites. Activation of macrophages is essential for the onset of a potent immune response, but insights into the effects of RABV on macrophage activation are scarce. In this study we performed high-throughput sequencing on RNA extracted from macrophages that were exposed to RABV for 48 hours, and compared their transcriptional profiles to that of non-polarized macrophages (M0), and macrophages polarized towards the canonical M1, M2a and M2c phenotypes. Our analysis revealed that RABV-stimulated macrophages show high expression of several M1, M2a and M2c signature genes. Apart from their partial resemblance to these phenotypes, unbiased clustering analysis revealed that RABV induces a unique and distinct polarization program. Closer examination revealed that RABV induced multiple pathways related to the interferon- and antiviral response, which were not induced under other classical polarization strategies. Surprisingly, our data show that RABV induces an activated rather than a fully suppressed macrophage phenotype, triggering virus-induced activation and polarization. This includes multiple genes with known antiviral (e.g. APOBEC3A, IFIT/OAS/TRIM genes), which may play a role in anti-RABV immunity.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.