MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.actatropica.2018.04.006
Кодирование пяти японских энцефалитных переносчиков комаров ДНК (Culex fuscocephala, Culex gelidus, Culex tritaeniorhynchus, Culex псевдовишнуи и Culex vishnui).
Аннотация
Кулексские комары могут выступать в качестве переносчиков нескольких важных заболеваний, включая японский энцефалит, вирус Западного Нила, Сент. Энцефалит Луиса и эцефалит экин. Помимо неврологических последствий, вызванных людьми, японский энцефалит может привести к аборту в свиньях и энцефалите у лошадей. Эффективная борьба с переносчиками болезней и ранняя диагностика, а также постоянное наблюдение за животными имеют решающее значение для борьбы с этим арбовирусным заболеванием. Однако успех операций по борьбе с переносчиками болезней связан с быстрым и надежным выявлением целевых видов и знанием их биологии и экологии. Поскольку штриховое кодирование японского энцефалита кулексными векторами ДНК почти не изучено, здесь мы провели оценку эффективности этого инструмента для выявления и анализа вариаций между пятью неучтенными кулексными векторами японского энцефалита, кулексом фускоцефала, кулексом гелидусом, кулексом тритаэниорхинхусом, кулексом псевдовишню и Кулексом висхну, опираясь на анализ гена митохондриала CO1. Изменения в диапазоне их пар оснований были объяснены сюжетом энтропии Hx. Были изучены различия между индивидуальными конкрециями и диапазонами по парам оснований. В регионе С (501-750 млрд. С. Тритаэниорхинхус продемонстрировал наибольшие колебания во всех диапазонах. Наблюдаемое генетическое расхождение было частично недискриминационным, т.е. общее расхождение внутри и между нуклеотидами составляло 0,0920 (0,92%) и 0,125 (1,25%), соответственно. Однако правило 10X точно соответствует внутривидовым различиям <3% для пяти выбранных видов Culex. Анализ отдельных участков рассеивания показал пороговые значения (10Х) 0,008 (0,08%), 0,005 (0,05%), 0,123 (1,23%), 0,033 (0,33%) и 0,019 (0,19%) для C. fuscocephala, C. gelidus, C. tritaeniorhynchus, C. псевдовишнуи и C. inchnui, соответственно. Самая высокая дистанция расхождений, т.е. от 0,465 до 0,546, была отмечена в C. trataeniorhynchus haplotype KU497604, KU497603, AB690847 и AB690854. Сравнительно, внутридивергенция между другими гаплотипами C. tritaeniorhynchus варьировалась от 0-0,056. Максимальное пассимоническое дерево было сформировано в виде отдельных конных скоплений с существенными ветвями, иллюстрирующими их тесную связь и значительные генетические отклонения. В целом это исследование добавляет ценные знания к молекулярной биологии и системным системам пяти неучтенных видов комаров, выступающих в качестве основных векторов японского энцефалита в азиатских странах.
Название и аннотация на языке оригинала
DNA barcoding of five Japanese encephalitis mosquito vectors (Culex fuscocephala, Culex gelidus, Culex tritaeniorhynchus, Culex pseudovishnui and Culex vishnui).
Culex mosquitoes can act as vectors of several important diseases, including Japanese encephalitis, West Nile virus, St. Louis encephalitis and equine encephalitis. Besides the neurological sequelae caused in humans, Japanese encephalitis can lead to abortion in sows and encephalitis in horses. Effective vector control and early diagnosis, along with continuous serosurveillance in animals, are crucial to fight this arboviral disease. However, the success of vector control operations is linked with the fast and reliable identification of targeted species, and knowledge about their biology and ecology. Since the DNA barcoding of Culex vectors of Japanese encephalitis is scarcely explored, here we evaluated the efficacy of this tool to identify and analyze the variations among five overlooked Culex vectors of Japanese encephalitis, Culex fuscocephala, Culex gelidus, Culex tritaeniorhynchus, Culex pseudovishnui and Culex vishnui, relying to the analysis of mitochondrial CO1 gene. Variations in their base pair range were elucidated by the entropy Hx plot. The differences among individual conspecifics and on base pair range across the same were studied. The C (501-750 bp) region showed a moderate variation among all the selected species. C. tritaeniorhynchus exhibited the highest variation in all the ranges. The observed genetic divergence was partially non-discriminatory. i.e., the overall intra- and inter nucleotide divergence was 0.0920 (0.92%) and 0.125 (1.25%), respectively. However, 10X rule fits accurately intraspecies divergence <3% for the five selected Culex species. The analysis of individual scatter plots showed threshold values (10X) of 0.008 (0.08%), 0.005 (0.05%), 0.123 (1.23%), 0.033 (0.33%) and 0.019 (0.19%) for C. fuscocephala, C. gelidus, C. tritaeniorhynchus, C. pseudovishnui and C. vishnui, respectively. The C. tritaeniorhynchus haplotypes KU497604, KU497603, AB690847 and AB690854 exhibited the highest divergence range, i.e., from 0.465 -0.546. Comparatively, the intra-divergence among the other haplotypes of C. tritaeniorhynchus ranged from 0-0.056. The maximum parsimony tree was formed by distinctive conspecific clusters with appreciable branch values illustrating their close congruence and extensive genetic deviations. Overall, this study adds valuable knowledge to the molecular biology and systematics of five overlooked mosquito species acting as major vectors of Japanese encephalitis in Asian countries.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.