MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1186/s13071-017-2351-x

Медицинская библиотека · Parasites & vectors · 2017

Молекулярная филогения группы Anopheles hircanus, основанная на данных IST2 rDNA.

Fang Yuan, Shi Wen-Qi, Zhang Yi

СтатьяМашинный перевод · не проверен

Аннотация

Группа Anopheles hircanus включает 25 видов и широко распространяется в Восточной и Палаурктической областях. Несколько видов в этой группе являются переносчиками малярии, лимфатического филариата и японского энцефалита. Сложно или невозможно идентифицировать загадочные виды на основе их морфологических характеристик, при этом некоторые тесно связанные с ними виды группы " Гиркан " имеют аналогичные морфологические характеристики для взрослых. Таким образом, их молекулярная идентификация является важным дополнительным методом к традиционной морфологической таксономии.Мы использовали 461 рибосомную ДНК (RDNA) внутреннюю транскрибированную орбитальную последовательность 2 (ITS2), касающуюся 19 видов, для восстановления молекулярной филогеники Гирканской группы по всему ее диапазону. Кроме того, мы сравнили производительность RDNA IST2 с митохондриальной ДНК (mtDNA) цитохрома с оксидазной субедикцией 1 (cox1) для оценки генетического расхождения между родными видами группы Hyrcanus.

Результаты

На основе 2-параметрической (K2P) модели дистанции Kimura среднее различие между SIS2 было 0,003, в то время как разница в последовательности между видами составляла в среднем 0,480. Средние расхождения в последовательности ИТС2 были почти в 160 раз выше среди членов Гирканской группы, чем в рамках каждого вида. Два вида сестринских видов: An. baseri Baisas & Hu, 1936 и An paraliae Sandosham, 1959; и An. sinensis Wiedemann, 1828, An. belenrae Rueda, 2005 и An. kleini Rueda, 2005 были урегулированы ITS2. Каждый из этих видов был представлен как независимый род в филогенетичном дереве. Результаты показывают, что An. псевдопиктус Грасси, 1899 год, и An. hircanus (Pallas, 1771 год) скорее всего являются одним видом. Мы обнаружили две новые линии ИТС2, которые требуют дальнейшего изучения, прежде чем урегулировать их подлинный таксономический статус, и разработали диагностическую цепную реакцию полимеразы (ПХД), чтобы выделить пять морфологических видов.

ВЫВОДЫ

Ядерные и митохондриальные гены, как правило, дают последовательные результаты для деления подгрупп. По сравнению с коксом 1, ITS2 является более надежным инструментом изучения филогенетических связей между тесно связанными с комарами такстами. Исходя из различий в последовательности ИТС2 для повышения эффективности идентификации векторов можно использовать разработанные здесь умноженные PCR анализы. Таким образом, это исследование будет способствовать прогрессу в области наблюдения за переносчиками малярии как в эпидемических, так и в неэпидемических районах Южной и Восточной Азии.

Для цитирования: Fang Yuan, Shi Wen-Qi, Zhang Yi. Molecular phylogeny of Anopheles hyrcanus group members based on ITS2 rDNA.. Parasites & vectors. 2017. DOI: 10.1186/s13071-017-2351-x.
Название и аннотация на языке оригинала

Molecular phylogeny of Anopheles hyrcanus group members based on ITS2 rDNA.

BACKGROUND

The Anopheles hyrcanus group includes 25 species, and is widely distributed in the Oriental and Palaearctic regions. Several species within this group are vectors of malaria, lymphatic filariasis and Japanese encephalitis. It is difficult or impossible to identify cryptic species based on their morphological characteristics, with some closely related species of the Hyrcanus Group have similar adult morphological characteristics. Thus, their molecular identification has been an important complementary method to traditional morphological taxonomy.

METHODS

We used 461 ribosomal DNA (rDNA) internal transcribed spacer 2 (ITS2) sequences relating to 19 species to reconstruct the molecular phylogeny of the Hyrcanus Group across its range. In addition, we compared the performance of rDNA ITS2 to that of mitochondrial DNA (mtDNA) cytochrome c oxidase subunit 1 gene (cox1) to assess the genetic divergence of Hyrcanus Group sibling species.

RESULTS

Based on Kimura's 2-parameter (K2P) distance model, the average conspecific ITS2 divergence was 0.003, whereas sequence divergence between species averaged 0.480. Average ITS2 sequence divergences were almost 160 times higher among the Hyrcanus Group members than within each species. Two sets of sibling species, An. lesteri Baisas & Hu, 1936 and An. paraliae Sandosham, 1959; and An. sinensis Wiedemann, 1828, An. belenrae Rueda, 2005, and An. kleini Rueda, 2005, were resolved by ITS2. Each of these species was represented as an independent lineage in the phylogenetic tree. Results suggest that An. pseudopictus Grassi, 1899 and An. hyrcanus (Pallas, 1771) are most likely a single species. We uncovered two new ITS2 lineages that require further study before resolving their true taxonomic status, and designed a diagnostic polymerase chain reaction (PCR) assay to distinguish five morphologically similar species.

CONCLUSIONS

Nuclear and mitochondrial genes generally provided consistent results for subgroup division. Compared to cox1, ITS2 is a more reliable tool for studying phylogenetic relationships among closely related mosquito taxa. Based on species-specific differences in ITS2 sequences, the multiplex PCR assay developed here can be used to improve the efficiency of vector identification. Thus, this research will promote the progress of malaria vector surveillance in both epidemic and non-epidemic areas of South and East Asia.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.