bioRxiv : the preprint server for biology · 2025
Telomeric assemblies of Paracoccidioides genomes.
СтатьяПрепринтНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Grinevich Dmitry, Kompathoum Oliver, Li Jingbaoyi, Turissini David A, Kelly Patrick, Sutherland McKenna, Marin-Carvajal Santiago, Gomez Oscar M, Benard Gil, Shikanai-Yasuda Maria Aparecida, Cocio Tiago Alexandre, Vicentini Adriana Pardini, de Camargo Zoilo Pires, Rodrigues Anderson Messias, Hahn Rosane Christine, Motta Beatriz da Silva, de Macedo Priscila Marques, Paes Rodrigo de Almeida, Alvarado Primavera, Zancopé-Oliveira Rosely Maria, McEwen Juan G, Sepúlveda Victoria E, Teixeira Marcus M, Matute Daniel R
Аннотация
Paracoccidioides is a genus of dimorphic fungal pathogens endemic to Latin America. We generated long-read de novo assemblies for 11 isolates representing four species of the brasiliensis complex (P. brasiliensis, P. americana, P. restrepiensis, P. venezuelensis) and P. lutzii. These include the first complete telomere-to-telomere assemblies for P. brasiliensis (Pb18) and P. americana (Pb03), each with five chromosomes. Comparative analyses revealed chromosomal fusion and fission events distinguishing P. brasiliensis and P. americana, and a 90 kb tandem duplication in P. americana containing siderophore biosynthesis genes (sid1, sid3, sid4), a cluster of putative virulence factors. Mitochondrial genomes showed conserved gene order but a phylogenetic topology inconsistent with the nuclear tree, suggesting mitochondrial introgression between P. lutzii and P. venezuelensis. RNA transposable elements were enriched near telomeres, correlated with genome size, and most abundant in P. lutzii. These assemblies provide key resources for understanding genome evolution and introgression in Paracoccidioides.