MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1002/jcc.27081

Медицинская библиотека · Journal of computational chemistry · 2023

Solvation free energy arithmetic for small organic molecules.

Lazaric Aleksandar, Pattni Viren, Fuegner Kaprao, Ben-Naim Arieh, Heyden Matthias

СтатьяПеревод в очереди

Аннотация

Solvent-mediated interactions contribute to ligand binding affinities in computational drug design and provide a challenge for theoretical predictions. In this study, we analyze the solvation free energy of benzene derivatives in water to guide the development of predictive models for solvation free energies and solvent-mediated interactions. We use a spatially resolved analysis of local solvation free energy contributions and define solvation free energy arithmetic, which enable us to construct additive models to describe the solvation of complex compounds. The substituents analyzed in this study are carboxyl and nitro-groups due to their similar sterical requirements but distinct interactions with water. We find that nonadditive solvation free energy contributions are primarily attributed to electrostatics, which are qualitatively reproduced with computationally efficient continuum models. This suggests a promising route for the development of efficient and accurate models for the solvation of complex molecules with varying substitution patterns using solvation arithmetic.

Для цитирования: Lazaric Aleksandar, Pattni Viren, Fuegner Kaprao, Ben-Naim Arieh, Heyden Matthias. Solvation free energy arithmetic for small organic molecules.. Journal of computational chemistry. 2023. DOI: 10.1002/jcc.27081.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.