MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.jviromet.2024.114893
Автоматизированное молекулярное обнаружение вируса Западного Нила в москитных пулах с использованием системы фьюзиации Пантера.
Аннотация
Вирус Западного Нила (WNV) — вирус, передаваемый через артропод, который распространяется через москитные векторы. WNV появился в США в 1999 году и с тех пор стал эндемичным в США, вызывая самую внутреннюю арбовирусную болезнь в стране. Наблюдение москито для ВНВ полезно для мониторинга бремени арбовирусных заболеваний во времени и в различных местах. RT-qPCR является предпочтительным методом наблюдения за ВНВ, но эти методы являются трудоемкими. Система " Panther Fusion System " имеет открытый доступ, позволяющий проводить лабораторные испытания (LDT) на полностью автоматизированной системе извлечения нуклеиновой кислоты, RT-qPCR и получения результатов. Это исследование демонстрирует успешную оптимизацию ВНВ-множества ЛДТ (мишени ENV и NS1) для высокопроизводительного экологического контроля для проверки однородности москитовых пулов в системе фьюзии Пантера. Аналитическая чувствительность анализа составила 186 и 744 экземпляра/реакции PCR для целей ENV и NS1, соответственно. Для оценки эффективности этого анализа было опробовано в общей сложности 80 комаров, в том числе 60 ранее испытанных пулов и 20 отрицательных пулов. Из 60 ранее испытанных образцов Panther Fusion WNV LDT продемонстрировали 100-процентное положительное и отрицательное согласие с исследованием CCD West Nile RT-qPCR. Panther Fusion WNV LDT также обнаружила все 20 копий. Проверки Panther Fusion WNV LDT были успешно разработаны и оптимизированы для проведения испытаний с высокой пропускной способностью с аналогичными характеристиками, которые использовались ранее CCD West Nile RT-qPCR.
Название и аннотация на языке оригинала
Automated molecular detection of West Nile Virus in mosquito pools using the Panther Fusion system.
West Nile Virus (WNV) is an arthropod-borne virus that is spread through mosquito vectors. WNV emerged in the US in 1999 and has since become endemic in the US, causing the most domestically acquired arboviral disease in the country. Mosquito surveillance for WNV is useful to monitor arboviral disease burden over time and across different locations. RT-qPCR is the preferred method for WNV surveillance, but these methods are labor-intensive. The Panther Fusion System has an Open Access feature that allows for laboratory-developed tests (LDTs) to run on a fully automated system for nucleic acid extraction, RT-qPCR, and result generation. This study demonstrates the successful optimization of a WNV multiplex LDT (assay targets: ENV and NS1 genes) for high-throughput environmental surveillance testing of mosquito pool homogenates on the Panther Fusion System. Analytical sensitivity of the assay was 186 and 744 copies/PCR reaction for the ENV and NS1 targets, respectively. To assess the performance of this assay, a total of 80 mosquito pools were tested, including 60 previously tested pools and 20 spiked negative mosquito pools. Among the 60 previously tested specimens, the Panther Fusion WNV LDT demonstrated 100% positive and negative agreement with the CDC West Nile RT-qPCR assay. The Panther Fusion WNV LDT also detected all 20 spiked specimens. The Panther Fusion WNV LDT assay was successfully developed and optimized for high throughput testing with similar performance to the previously used CDC West Nile RT-qPCR assay.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.