Молекулярная филогография вируса энцефалита, переносимого клещами, в Центральной Европе.
Аннотация
В целях более глубокого понимания процессов движения штаммов вируса энцефалита (ТБЭВ), переносимого клещами, в Центральной Европе были определены генные последовательности Е 102 штаммов ТБЭВ, собранные в период с 1953 по 2011 год на 38 участках в Чешской Республике, Словакии, Австрии и Германии. Байезийский анализ показывает 350-летнюю историю эволюции и распространение в Центральной Европе двух основных линий - А и В. В отличие от востока и запада на уровне Евразийского континента местные центральноевропейские модели расползания указывают на исторический разброс запада и востока, за которым следует более недавнее расползание востока на запад. Филогенетические и сетевые анализы показывают, что ТБЭВ попадает из Чешской Республики и Словакии в Германию через ландшафтные особенности (диапазонная речная система), биогенные факторы (птички, красный олень) и антропогенные факторы. Выявление эндемических форм, демонстрирующих местное генетическое разнообразие, имеет первостепенное значение для деятельности на местах, поскольку они будут являться предпосылкой для углубленного анализа основного обслуживания ТБЭВ и распространения ТБЭМ на большие расстояния.
Название и аннотация на языке оригинала
Molecular phylogeography of tick-borne encephalitis virus in central Europe.
In order to obtain a better understanding of tick-borne encephalitis virus (TBEV) strain movements in central Europe the E gene sequences of 102 TBEV strains collected from 1953 to 2011 at 38 sites in the Czech Republic, Slovakia, Austria and Germany were determined. Bayesian analysis suggests a 350-year history of evolution and spread in central Europe of two main lineages, A and B. In contrast to the east to west spread at the Eurasian continent level, local central European spreading patterns suggest historic west to east spread followed by more recent east to west spread. The phylogenetic and network analyses indicate TBEV ingressions from the Czech Republic and Slovakia into Germany via landscape features (Danube river system), biogenic factors (birds, red deer) and anthropogenic factors. The identification of endemic foci showing local genetic diversity is of paramount importance to the field as these will be a prerequisite for in-depth analysis of focal TBEV maintenance and long-distance TBEV spread.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.