Комплексная многомерная характеристика молекулярного подтипа, связанного с митофагией, и биомаркировка в сепсисе.

Как опасное для жизни состояние, обусловленное дисрегулированной реакцией хост-компании на инфекцию, сепсис страдает высокой смертностью и неоднородностью. Митофагия представляет собой выборочное удаление поврежденной митохондрии, которая участвует в смягчении ущерба, связанного с сепсисом. Систематическое выявление и проверка ключевых генов, связанных с митофагией (MAG), для диагностики сепсиса, стратификации и иммунной модуляции отсутствуют. Для дифференциального анализа выражений, анализа взвешенной Gen co-выраженной сети (WGCNA) и машинного обучения были интегрированы массивы массивов данных. Мы проанализировали одноклеточные данные RNA-seq для картирования выражения MAG, провели анализ иммунной инфильтрации с помощью системы ESTIMATE, одновыборный анализ гене Set Enrichment Analysis (SSGSEA) и провели консенсусное кластерирование на основе MAG для молекулярной подстилки. В ходе проверки MAG роль NUP93 была функционально проверена в митофагии с использованием липополизакхарида (LPS) на основе расчета RAW264.7 клеток с аденовальным перевыражением. Интеграция машинного обучения выявила четыре биомаркера MAG (RPL18, PRPF8, NUP93, CUL1) с высокой диагностической мощностью (индивидуальные AUC 0,957-0,975, номограмма AUC = 0,990). Консенсус, основанный на этих стратифицированных больных сепсисом, сгруппирован в различные молекулярные подтипы с различными выражениями MAG, иммунными ландшафтами и лежащими в основе иммунными путями. NUP93, чрезмерное выражение в vitro, спасло вызванное ЛПС нарушение митофагии, восстановив уровни митохондриала PINK1 и LC3B. В этом исследовании RPL18, PRPF8, NUP93 и CUL1 определяются как надежные диагностические биомаркеры MAG для сепсиса, демонстрируют их полезность для определения молекулярных подтипов с различными иммунными микроокружениями и дают функциональные доказательства того, что NUP93 поощряет митофагию во время сепсиса, предлагая новые инструменты для точной диагностики и осмысления целевых терапевтических стратегий.