MedElevator
Войти в исследования Индейка B Клеточный транскриптомный профиль во время турецкого геморрагического вируса энтерита (THEV)
Аннотация
Инфекция геморрагическим энтеритом индейки (THEV) может вызвать геморрагический энтерит, от которого страдают молодые индейки. Эта болезнь характеризуется кровопролитным диареей и иммунодепрессией (ИМС), что объясняется апоптозом инфицированных клеток B. Вторичные инфекции, вызванные МСМ, усугубляют экономические потери. Мы провели первый транскриптивный анализ инфекции ТЭВ, чтобы прояснить механизмы, с помощью которых происходит спровоцированная ТЭВ МСМ. После заражения и секвенирования mRNAs линии индейки B-клеток были нанесены скрипты генома индейки, а выражение гена было определено с помощью стрингти. После дифференциального анализа выражения генов проводились функциональные анализы обогащения с использованием гларр2 и DAVID из NCDI. RT-qPCR отдельных генов был выполнен для проверки данных RNA-seq. Было выявлено в общей сложности 2343 и 3295 дифференциально выраженных генов (DEG) на уровне 12 и 24 hpi, соответственно. ДЭГ соотносились с многочисленными биологическими процессами, включая апоптоз, реакцию на белки и обслуживание клеток. Регулировались многочисленные проапоптотические гены, включая APAF1, BMF, BAK1 и FAS. Гены, играющие определенную роль в реакции белка, вызванного стрессом, включая VCP, UFD1, EDEM1 и ATF4, также были регулируются и могут способствовать апоптозу. Наши данные свидетельствуют о том, что некоторые биологические процессы и пути, включая апоптоз и реакцию ЧП на стресс, являются важными аспектами реакции принимающих клеток на инфекцию ТЭВ. Возможно, что взаимодействие между различными процессами может служить посредником в апоптозе инфицированных клеток В, что приведет к МСМ.
Название и аннотация на языке оригинала
Turkey B Cell Transcriptome Profile During Turkey Hemorrhagic Enteritis Virus (THEV) Infection Highlights Upregulated Apoptosis and Breakdown Pathways That May Mediate Immunosuppression.
Infection with the turkey hemorrhagic enteritis virus (THEV) can cause hemorrhagic enteritis, which affects young turkeys. This disease is characterized by bloody diarrhea and immunosuppression (IMS), which is attributed to apoptosis of infected B cells. Secondary infections due to IMS exacerbate economic losses. We performed the first transcriptomic analysis of a THEV infection to elucidate the mechanisms mediating THEV-induced IMS. After infecting and sequencing mRNAs of a turkey B-cell line, trimmed reads were mapped to the host turkey genome, and gene expression was quantified with StringTie. Differential gene expression analysis was followed by functional enrichment analyses using gprofiler2 and DAVID from NCBI. RT-qPCR of select genes was performed to validate the RNA-seq data. A total of 2343 and 3295 differentially expressed genes (DEGs) were identified at 12 hpi and 24 hpi, respectively. The DEGs correlated with multiple biological processes including apoptosis, ER unfolded protein response, and cell maintenance. Multiple pro-apoptotic genes, including APAF1, BMF, BAK1, and FAS were upregulated. Genes that play a role in ER stress-induced unfolded protein response including VCP, UFD1, EDEM1, and ATF4 were also upregulated and may contribute to apoptosis. Our data suggest that several biological processes and pathways including apoptosis and ER response to stress are important aspects of the host cell response to THEV infection. It is possible that interplay between multiple processes may mediate apoptosis of infected B-cells, leading to IMS.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.