MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/0042-6822(89)90246-8
Геологическая последовательность вируса энцефалита (западный подтип) и сравнительный анализ неструктурных белков с другими флавивирусами.
Аннотация
Была определена последовательность генома вируса энцефалита, переносимого клещей (ТБЭ) (напряжение вакцины западного подтипа Нойдоерфл). Это распространяет ранее опубликованную последовательность структурных белков на область неструктурного белка и некодирующие последовательности на 5' и 3'-термини. Аминотермини отдельных белков были присвоены по сравнению с другими последовательности флавивирусов. В отношении всех неструктурных белков были произведены расчеты аминокислотных гомологий между вирусом ТБЭ и переносимыми комарами флавивирусами. В нем представлено эволюционное дерево, основанное на протеине NS1, которое показывает молекулярную основу взаимоотношений между флавивирусами. Флавивирусы, передающиеся через Тика и комаров, имеют общий гидрофильный профиль, а также другие характеристики их первичных последовательностей, такие, как, предположительно, функциональный элемент последовательности Gly-Asp-Asp в протеине NS5. Другие характеристики, такие, как потенциальные участки N-гликозилирования белка NS1 и потенциальные протеолытические декольте в белке NS4B, сохраняются в группе, переходящей через комары, но различаются по последовательности вирусов ТБЭ.
Название и аннотация на языке оригинала
Genome sequence of tick-borne encephalitis virus (Western subtype) and comparative analysis of nonstructural proteins with other flaviviruses.
The genome sequence of tick-borne encephalitis (TBE) virus (Western subtype vaccine strain Neudoerfl) was determined. This extends the previously published sequence of the structural proteins to the nonstructural protein region and noncoding sequences at the 5'- and 3'-termini. The amino-termini of the individual proteins were assigned by comparison with other flavivirus sequences. Amino acid homology calculations between TBE virus and mosquito-borne flaviviruses were performed for all nonstructural proteins. An evolutionary tree based on protein NS1 is presented that reveals the molecular basis of relationships among flaviviruses. Tick-borne and mosquito-borne flaviviruses share a common hydrophilicity profile and also other features of their primary sequences, such as the presumably functional Gly-Asp-Asp sequence element within protein NS5. Other characteristics, such as the potential N-glycosylation sites of protein NS1 and a potential proteolytic cleavage site within protein NS4B, are conserved within the mosquito-borne group, but differ in the TBE virus sequence.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.