Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) · 2019
Amplicon-Based Targeted Next-Generation Sequencing of Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Tissue.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Strengman Eric, Barendrecht-Smouter Francoise A S, de Voijs Carmen, de Vree Paula, Nijman Isaac J, de Leng Wendy W J
Аннотация
Next-generation sequencing (NGS) is rapidly becoming the method of choice for mutation analysis in both research and diagnostics. The benefit of targeted NGS compared to whole-genome and whole-exome sequencing is that smaller amounts of input material can be used as well as qualitatively suboptimal tissue samples, like formalin-fixed, paraffin-embedded archival tissue.Here, we describe the protocol for targeted next-generation sequencing using the Ion Torrent PGM platform in combination with Ion Ampliseq NGS gene panels for formalin-fixed, paraffin-embedded tissues. Both the manual and the automated workflow are described as well as the bioinformatics for data analysis.